登録情報 | データベース: PDB / ID: 4b17 |
---|
タイトル | Crystal structure of C2498 2'-O-ribose methyltransferase RlmM from Escherichia coli in complex with S-adenosylmethionine |
---|
要素 | RIBOSOMAL RNA LARGE SUBUNIT METHYLTRANSFERASE M |
---|
キーワード | TRANSFERASE |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
23S rRNA (cytidine2498-2'-O)-methyltransferase / rRNA (cytosine-2'-O-)-methyltransferase activity / rRNA processing / cytoplasm類似検索 - 分子機能 THUMP fold - #20 / Alpha-Beta Plaits - #2810 / Ribosomal RNA large subunit methyltransferase M / RlmM ferredoxin-like domain / : / RlmM ferredoxin-like domain / Ribosomal RNA large subunit methyltransferase M, N-terminal / THUMP fold / Ribosomal RNA methyltransferase, FtsJ domain / FtsJ-like methyltransferase ...THUMP fold - #20 / Alpha-Beta Plaits - #2810 / Ribosomal RNA large subunit methyltransferase M / RlmM ferredoxin-like domain / : / RlmM ferredoxin-like domain / Ribosomal RNA large subunit methyltransferase M, N-terminal / THUMP fold / Ribosomal RNA methyltransferase, FtsJ domain / FtsJ-like methyltransferase / Vaccinia Virus protein VP39 / Alpha-Beta Plaits / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 S-ADENOSYLMETHIONINE / Ribosomal RNA large subunit methyltransferase M類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | ESCHERICHIA COLI (大腸菌) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.6 Å |
---|
データ登録者 | Punekar, A.S. / Shepherd, T.R. / Liljeruhm, J. / Forster, A.C. / Selmer, M. |
---|
引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2012 タイトル: Crystal Structure of Rlmm, the 2'O-Ribose Methyltransferase for C2498 of Escherichia Coli 23S Rrna. 著者: Punekar, A.S. / Shepherd, T.R. / Liljeruhm, J. / Forster, A.C. / Selmer, M. |
---|
履歴 | 登録 | 2012年7月7日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
---|
改定 1.0 | 2012年8月15日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2012年11月14日 | Group: Database references |
---|
改定 1.2 | 2018年1月17日 | Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_source / Item: _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site |
---|
改定 1.3 | 2023年12月20日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
|
---|
Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. |
---|