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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 4aou
タイトル
CtIDH bound to NADP. The complex structures of Isocitrate dehydrogenase from Clostridium thermocellum and Desulfotalea psychrophila, support a new active site locking mechanism
温度: 310 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 詳細: HANGING DROP METHOD. RESERVOIR SOLUTIONS OF 9-11% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) PEG3350, AND 0.15 M AMMONIUM DIHYDROGEN CITRATE, 10% (V/V/) PROPYLENE GLYCOL AT 37 DEG. C. CTIDH-NADP AT 5 ...詳細: HANGING DROP METHOD. RESERVOIR SOLUTIONS OF 9-11% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) PEG3350, AND 0.15 M AMMONIUM DIHYDROGEN CITRATE, 10% (V/V/) PROPYLENE GLYCOL AT 37 DEG. C. CTIDH-NADP AT 5 MG/ML, 10 MM NADP AND 10 MM DL-ISOCITRATE.
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.9184 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.5→45 Å / Num. obs: 20411 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 5 % / Biso Wilson estimate: 56.17 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.13 / Net I/σ(I): 0
反射 シェル
解像度: 2.5→2.64 Å / 冗長度: 5 % / Rmerge(I) obs: 0.61 / Mean I/σ(I) obs: 2.8 / % possible all: 100
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解析
ソフトウェア
名称: REFMAC / バージョン: 5.4.0069 / 分類: 精密化
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.5→45 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.95 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.924 / SU B: 7.724 / SU ML: 0.173 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.349 / ESU R Free: 0.256 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.24403
1043
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.18931
-
-
-
obs
0.19197
19347
99.89 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK