SUCCINYLORNITHINE (SUO): SUCCINYLORNITHINE SYNTHESISED IN HOUSE
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実験情報
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実験
実験
手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 4
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試料調製
結晶
マシュー密度: 3.43 Å3/Da / 溶媒含有率: 64.2 % / 解説: NONE
結晶化
温度: 293 K / pH: 9 詳細: 1.5 M AMMONIUM SULFATE, 10% (V/V) MMT (MALATE-MES-TRIS) BUFFER AT PH 9.0, 293K, 150 PLUS 150 NL DROPS. PROTEIN HAD PLP AND SUCCINYLORNITHINE PREVIOUSLY ADDED.
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.95369 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.45→19.8 Å / Num. obs: 85143 / % possible obs: 99.8 % / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 5.9 % / Rmerge(I) obs: 0.15 / Net I/σ(I): 10.6
反射 シェル
解像度: 2.45→2.58 Å / 冗長度: 5.9 % / Rmerge(I) obs: 0.63 / Mean I/σ(I) obs: 2.9 / % possible all: 100
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.6.0117
精密化
XDS
データ削減
SCALA
データスケーリング
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: PREVIOUSLY-DETERMINED NATIVE 解像度: 2.45→108.46 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.952 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.919 / SU B: 7.609 / SU ML: 0.166 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.277 / ESU R Free: 0.223 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN TH INPUT. U VALUES REFINED INDIVIDUALLY. THERE IS A SMALL AMOUNT OF POSITIVE ELECTRON DENSITY THAT COULD NOT BE MODELLED WELL.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.22534
4254
5 %
RANDOM
Rwork
0.17026
-
-
-
obs
0.17303
80886
99.77 %
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溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK