ソフトウェア 名称 バージョン 分類 X-PLORモデル構築 X-PLOR3.843 精密化 DENZOデータ削減 SCALEPACKデータスケーリング X-PLOR位相決定
精密化 構造決定の手法 : MOLECULAR REPLACEMEN開始モデル : IDEAL B-DNA
解像度 : 1.43→8 Å / 交差検証法 : THROUGHOUT / σ(F) : 2 詳細 : STARTING MODEL IS IDEAL B-DNA RMS-FITTED ONTO COORDINATES OF ORIGINAL DREW STRUCTURE (1BNA)Rfactor 反射数 %反射 Selection details Rfree 0.276 1055 10 % RANDOM Rwork 0.208 - - - obs 0.208 11016 88.5 % -
原子変位パラメータ Biso mean : 13.56 Å2 Baniso -1 Baniso -2 Baniso -3 1- 3.65 Å2 0 Å2 0 Å2 2- - -3.12 Å2 0 Å2 3- - - -1.4 Å2
精密化ステップ サイクル : LAST / 解像度 : 1.43→8 Åタンパク質 核酸 リガンド 溶媒 全体 原子数 0 486 28 133 647
拘束条件 大きな表を表示 (3 x 19) 大きな表を隠す Refine-ID タイプ Dev ideal X-RAY DIFFRACTION x_bond_d0.009 X-RAY DIFFRACTION x_bond_d_naX-RAY DIFFRACTION x_bond_d_protX-RAY DIFFRACTION x_angle_dX-RAY DIFFRACTION x_angle_d_naX-RAY DIFFRACTION x_angle_d_protX-RAY DIFFRACTION x_angle_deg1.7 X-RAY DIFFRACTION x_angle_deg_naX-RAY DIFFRACTION x_angle_deg_protX-RAY DIFFRACTION x_dihedral_angle_d18.65 X-RAY DIFFRACTION x_dihedral_angle_d_naX-RAY DIFFRACTION x_dihedral_angle_d_protX-RAY DIFFRACTION x_improper_angle_d1.46 X-RAY DIFFRACTION x_improper_angle_d_naX-RAY DIFFRACTION x_improper_angle_d_protX-RAY DIFFRACTION x_mcbond_itX-RAY DIFFRACTION x_mcangle_itX-RAY DIFFRACTION x_scbond_itX-RAY DIFFRACTION x_scangle_it
ソフトウェア *PLUS
名称 : X-PLOR / バージョン : 3.843 / 分類 : refinement精密化 *PLUS
最低解像度 : 8 Å / σ(F) : 2 / % reflection Rfree : 10 %溶媒の処理 *PLUS
原子変位パラメータ *PLUS
拘束条件 *PLUS
Refine-ID タイプ Dev ideal X-RAY DIFFRACTION x_dihedral_angle_dX-RAY DIFFRACTION x_dihedral_angle_deg18.65 X-RAY DIFFRACTION x_improper_angle_dX-RAY DIFFRACTION x_improper_angle_deg1.46