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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 447d | ||||||||||||||||||
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タイトル | 5'-D(*CP*GP*CP*GP*AP*AP*TP*TP*CP*GP*CP*G)-3' | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / B-DNA / MINOR GROOVE BINDING | 機能・相同性 | Chem-BBZ / DNA / DNA (> 10) | ![]() 手法 | ![]() ![]() Squire, C.J. / Baker, L.J. / Clark, G.R. / Martin, R.F. / White, J. | ![]() ![]() タイトル: Structures of m-iodo Hoechst-DNA complexes in crystals with reduced solvent content: implications for minor groove binder drug design. 著者: Squire, C.J. / Baker, L.J. / Clark, G.R. / Martin, R.F. / White, J. #1: ![]() タイトル: Intermolecular interactions and water structure in a condensed phase B-DNA crystal 著者: Clark, G.R. / Squire, C.J. / Baker, L.J. / Martin, R.F. / White, J. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 22.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 14.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3663.392 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 #2: 化合物 | ChemComp-BBZ / | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.95 Å3/Da / 溶媒含有率: 36.86 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7 詳細: pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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結晶化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: BRUKER SMART / 検出器: CCD / 日付: 1997年5月31日 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.7107 Å / 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 2.2 Å / Num. all: 3206 / Num. obs: 3206 / % possible obs: 96 % / Observed criterion σ(F): 0 / 冗長度: 6.33 % / Rmerge(I) obs: 0.141 |
反射 シェル | 解像度: 2.199→2.278 Å / Rmerge(I) obs: 0.521 |
反射 | *PLUS Num. obs: 2628 / Observed criterion σ(F): 2 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→8 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→8 Å
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拘束条件 |
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