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- PDB-3zp7: Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis in complex with c... -

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基本情報

登録情報

データベース: PDB / ID: 3zp7

タイトル

Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis in complex with chorismate and prephenate

要素

CHORISMATE MUTASE AROH

キーワード

ISOMERASE / PSEUDO-ALPHA BETA-BARREL / NON-PROTEINOGENIC AMINO ACID / SEMI-SYNTHETIC / REACTION MECHANISM

機能・相同性

機能・相同性情報

chorismate metabolic process / chorismate mutase / chorismate mutase activity / aromatic amino acid family biosynthetic process / amino acid biosynthetic process / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

BACILLUS SUBTILIS (枯草菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.698 Å

データ登録者

Burschowsky, D. / vanEerde, A. / Okvist, M. / Kienhofer, A. / Kast, P. / Hilvert, D. / Krengel, U.

引用

ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2014
タイトル: Electrostatic Transition State Stabilization Rather Than Reactant Destabilization Provides the Chemical Basis for Efficient Chorismate Mutase Catalysis.
著者: Burschowsky, D. / Van Eerde, A. / Okvist, M. / Kienhofer, A. / Kast, P. / Hilvert, D. / Krengel, U.

履歴

登録	2013年2月26日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2014年4月16日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2014年8月13日	Group: Atomic model / Derived calculations
改定 1.2	2014年11月26日	Group: Database references
改定 1.3	2014年12月3日	Group: Database references
改定 1.4	2014年12月10日	Group: Database references
改定 1.5	2014年12月24日	Group: Database references
改定 2.0	2023年11月15日	Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Other カテゴリ: atom_site / atom_site_anisotrop ...atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / struct_conn / struct_site Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 2.1	2023年12月20日	Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model
改定 2.2	2024年11月13日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

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構造の表示

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロードとリンク

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3zp7.cif.gz	318.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3zp7.ent.gz	266 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3zp7.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3zp7_validation.pdf.gz	510.5 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3zp7_full_validation.pdf.gz	530.9 KB	表示
XML形式データ	3zp7_validation.xml.gz	37.4 KB	表示
CIF形式データ	3zp7_validation.cif.gz	51 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zp/3zp7 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zp/3zp7	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3zo8C 3zopC 3zp4C 1dbfS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3zop-1 2cht-2 1xho-d 3zop-2 3zp4-2 1com-2 1com-1 3kjj-2 3k1u-d 5d4p-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#124 - 2010年4月コンカナバリンAと循環置換 (Concanavalin A and Circular Permutation) 類似性 (5)

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集合体

登録構造単位

A: CHORISMATE MUTASE AROH

B: CHORISMATE MUTASE AROH

C: CHORISMATE MUTASE AROH

D: CHORISMATE MUTASE AROH

E: CHORISMATE MUTASE AROH

F: CHORISMATE MUTASE AROH

ヘテロ分子

89.4 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

D: CHORISMATE MUTASE AROH

E: CHORISMATE MUTASE AROH

F: CHORISMATE MUTASE AROH

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
44.5 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

A: CHORISMATE MUTASE AROH

B: CHORISMATE MUTASE AROH

C: CHORISMATE MUTASE AROH

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
44.9 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	50.245, 51.307, 70.138
Angle α, β, γ (deg.)	97.51, 92.91, 101.11
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1

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要素

#1: タンパク質	CHORISMATE MUTASE AROH / CHORISMATE MUTASE / CM 分子量: 14521.919 Da / 分子数: 6 / 変異: YES / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) BACILLUS SUBTILIS (枯草菌) / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 参照: UniProt: P19080, chorismate mutase
#2: 化合物	ChemComp-PRE / PREPHENIC ACID / プレフェン酸分子量: 226.183 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₀O₆
#3: 化合物	ChemComp-ISJ / (3R,4R)-3-[(1-carboxyethenyl)oxy]-4-hydroxycyclohexa-1,5-diene-1-carboxylic acid / Chorismic Acid / コリスミン酸分子量: 226.183 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₀O₆
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 563 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y
非ポリマーの詳細	CHORISMATE (ISJ): CHEBI ENTRY 29748 --- CHORISMATE IS MOSTLY DEPROTONATED AT THE PH THAT WAS USED, ...CHORISMATE (ISJ): CHEBI ENTRY 29748 --- CHORISMATE IS MOSTLY DEPROTONATED AT THE PH THAT WAS USED, BUT THE NAME CHORISMIC ACID, C10 H10 O6, COULD ALSO BE USED. PREPHENIC ACID (PRE): PREPHENIC ACID IS DEPROTONATED AT THE PH THAT WAS USED, AND SHOULD THEREFORE BE PRESENT AS PREPHENATE C10 H8 O6

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実験情報

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 2.28 Å³/Da / 溶媒含有率: 46.13 % / 解説: NONE
結晶化	pH: 6 詳細: 100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 125 MM CALCIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000

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データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID23-2 / 波長: 0.8726
検出器	タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2011年10月1日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.8726 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.7→49.15 Å / Num. obs: 70311 / % possible obs: 93.7 % / 冗長度: 1.9 % / B_iso Wilson estimate: 15.27 Å² / R_merge(I) obs: 0.03 / Net I/σ(I): 15.5
反射シェル	解像度: 1.7→1.79 Å / 冗長度: 1.9 % / R_merge(I) obs: 0.17 / Mean I/σ(I) obs: 4.3 / % possible all: 92.8

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解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(PHENIX.REFINE)	精密化
XDS		データ削減
XDS		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1DBF

1dbf

解像度: 1.698→37.964 Å / SU ML: 0.23 / σ(F): 1.98 / 位相誤差: 20.14 / 立体化学のターゲット値: ML
詳細: INITIAL REFINEMENTS WERE PERFORMED WITH REFMAC. FINAL REFINEMENT WAS PERFORMED WITH PHENIX.REFINE.

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2185	3546	5 %
R_work	0.165	-	-
obs	0.1677	70310	93.74 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.98 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 27.171 Å² / k_sol: 0.329 e/Å³

原子変位パラメータ

B_iso mean: 20.072 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.1879 Å²	-0.4823 Å²	-0.1339 Å²
2-	-	-0.1003 Å²	-0.503 Å²
3-	-	-	-0.0877 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.698→37.964 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5592	0	160	563	6315

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	6019
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.043	8180
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	17.352	2435
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.07	975
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	1057

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.698-1.7213	0.3289	147	0.2607	2479	X-RAY DIFFRACTION	88
1.7213-1.7459	0.2815	143	0.229	2707	X-RAY DIFFRACTION	95
1.7459-1.7719	0.2911	148	0.227	2685	X-RAY DIFFRACTION	95
1.7719-1.7996	0.2897	144	0.2164	2707	X-RAY DIFFRACTION	95
1.7996-1.8291	0.2805	134	0.2026	2714	X-RAY DIFFRACTION	95
1.8291-1.8606	0.2333	142	0.182	2672	X-RAY DIFFRACTION	95
1.8606-1.8945	0.2516	129	0.1753	2695	X-RAY DIFFRACTION	93
1.8945-1.9309	0.2385	143	0.1701	2568	X-RAY DIFFRACTION	91
1.9309-1.9703	0.2314	152	0.1667	2653	X-RAY DIFFRACTION	93
1.9703-2.0132	0.2253	142	0.162	2702	X-RAY DIFFRACTION	94
2.0132-2.06	0.2191	153	0.1586	2674	X-RAY DIFFRACTION	94
2.06-2.1115	0.2331	138	0.1586	2550	X-RAY DIFFRACTION	90
2.1115-2.1686	0.2057	138	0.1647	2681	X-RAY DIFFRACTION	95
2.1686-2.2324	0.22	142	0.1614	2727	X-RAY DIFFRACTION	95
2.2324-2.3044	0.2188	131	0.159	2597	X-RAY DIFFRACTION	91
2.3044-2.3868	0.2084	136	0.161	2728	X-RAY DIFFRACTION	95
2.3868-2.4823	0.2074	132	0.1601	2730	X-RAY DIFFRACTION	96
2.4823-2.5953	0.2182	127	0.1663	2722	X-RAY DIFFRACTION	95
2.5953-2.7321	0.2194	152	0.1768	2635	X-RAY DIFFRACTION	94
2.7321-2.9032	0.243	157	0.1696	2722	X-RAY DIFFRACTION	95
2.9032-3.1273	0.2268	152	0.1843	2694	X-RAY DIFFRACTION	95
3.1273-3.4418	0.216	139	0.1701	2686	X-RAY DIFFRACTION	95
3.4418-3.9394	0.1974	154	0.1454	2646	X-RAY DIFFRACTION	93
3.9394-4.9614	0.1583	127	0.1221	2690	X-RAY DIFFRACTION	94
4.9614-37.9736	0.1927	144	0.1574	2700	X-RAY DIFFRACTION	95

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	7.9223	0.749	-2.0127	7.3789	-3.4277	6.1129	-0.0927	0.7122	-0.2812	-0.6591	-0.0202	0.5827	0.3179	-0.4976	0.0765	0.1023	0.0181	-0.0154	0.1201	-0.0206	0.1203	-2.4293	-3.7093	-0.9353
2	5.3445	1.2231	3.6479	1.1338	1.053	3.0351	-0.0487	0.056	0.0855	-0.0165	-0.0186	-0.0221	-0.3283	0.6183	0.0782	0.1058	-0.0137	0.0317	0.1978	-0.02	0.0333	5.1701	1.6273	17.4141
3	1.8263	-1.7485	-1.16	3.0218	0.0051	3.4367	-0.1002	-0.3163	-0.0226	0.533	0.146	0.0568	-0.014	-0.0449	-0.0468	0.2902	-0.0891	0.0021	0.3465	0.0711	0.0168	12.1939	-4.0469	28.3643
4	5.4197	-1.1541	-0.0247	7.0488	0.3735	6.0316	-0.0999	-0.5558	0.0075	0.7734	0.1558	0.3138	-0.0679	-0.2091	-0.0174	0.205	-0.0553	0.0408	0.2854	0.0458	0.0363	6.6753	-5.8229	24.0173
5	1.8974	0.3845	-0.6228	0.9739	-1.2383	2.9781	-0.0596	-0.365	-0.215	0.2144	0.0089	0.0905	0.0746	-0.0385	0.011	0.1935	-0.0999	0.1086	0.2295	0.0299	0.0879	-0.747	-6.4145	18.7839
6	8.1374	-1.231	2.1755	7.1574	-2.4144	7.2373	0.051	-0.6216	0.0828	0.7434	-0.0068	0.6221	-0.1642	-0.6129	-0.0564	0.124	-0.0256	0.0491	0.182	-0.0205	0.1177	-7.0041	-5.3558	12.0339
7	2.6582	-1.0015	-2.6801	4.081	-1.3092	5.6589	-0.0671	-0.0773	-0.342	-0.0932	-0.0681	0.4315	0.3126	-0.3199	0.0954	0.0732	-0.0334	0.0006	0.1026	0.0101	0.1041	-0.9117	-12.3525	4.6847
8	3.133	4.0695	3.6675	5.5312	4.8985	4.3661	0.213	-0.1805	-0.0039	0.3251	-0.2474	0.107	0.3532	-0.4143	0.0538	0.1039	-0.0202	0.0239	0.1241	-0.0054	0.0596	9.1616	-4.9738	10.7705
9	1.3728	0.4126	2.0992	6.501	-3.7144	6.1715	0.0335	-0.4425	0.0228	0.2008	-0.2799	-0.4093	0.0483	0.1641	0.2358	0.0781	-0.018	-0.0058	0.1448	0.0255	0.0962	17.6737	0.6121	20.6256
10	5.2514	-0.0867	3.2286	0.1618	0.3514	3.0075	0.2004	-0.3135	-0.3722	0.0917	-0.0454	-0.0131	0.3531	-0.1004	-0.1529	0.1793	-0.0233	-0.0271	0.2197	0.0825	0.1211	12.7328	-9.9473	18.695
11	4.5451	3.8007	1.838	6.4779	4.576	7.2098	0.1849	-0.6161	-0.6191	0.7089	-0.3004	-0.4258	0.4568	0.4373	0.1484	0.2279	-0.103	-0.0503	0.2408	0.1172	0.2271	3.7491	-15.9039	16.4131
12	4.0874	-0.6206	-0.7182	1.7608	-0.7646	3.208	0.0296	-0.1919	-0.5412	0.249	-0.0873	0.122	0.5498	-0.0409	-0.0429	0.2034	-0.0198	0.0057	0.0749	0.0623	0.1877	3.448	-17.6993	9.5436
13	8.5548	1.3011	7.922	1.8201	1.2733	7.927	-0.4873	0.2968	0.1187	-0.4893	0.3078	-0.0104	-0.4042	0.2998	0.0733	0.1046	-0.0069	0.0193	0.1021	-0.0109	0.0977	12.7981	-7.3266	8.8487
14	0.5946	-0.0497	-0.0397	3.9016	4.2929	4.79	0.0047	-0.0566	0.0879	0.2381	0.1093	-0.276	0.0148	-0.0278	-0.1061	0.1078	0.0249	-0.0024	0.0796	0.0305	0.0718	16.785	8.2419	14.3225
15	1.4104	-0.8802	2.0583	3.2891	-0.3116	3.3496	-0.0618	-0.1658	0.1009	0.3383	0.1248	-0.4272	-0.445	0.5324	-0.0135	0.1304	-0.0329	-0.0104	0.2261	-0.0182	0.0602	11.2246	4.5617	20.6318
16	6.7706	3.0904	6.6619	5.2419	2.0436	8.5274	0.0513	-0.0592	-0.1384	0.0423	-0.075	0.0129	-0.0527	-0.1012	0.0097	0.0721	0.0239	0.0274	0.1018	0.0008	0.0604	0.7039	-5.4407	4.2755
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103	6.9015	-4.5202	-4.7339	3.2462	3.8378	8.4944	0.0594	0.8986	0.7724	-0.8473	-0.2898	0.3175	-0.7668	-0.6505	0.1998	0.2478	0.028	-0.0852	0.2919	0.046	0.2274	20.0655	27.5317	18.9104
104	1.2109	-0.1103	0.4921	1.9635	2.5242	5.3865	0.071	0.8019	0.6727	-1.0059	-0.0728	-0.1622	-0.6181	-0.0048	0.0632	0.2483	0.0095	-0.0262	0.2701	0.1178	0.1913	26.7154	27.9675	18.4525
105	3.6381	1.2508	-1.8402	6.4371	2.1315	5.5537	0.1237	0.473	0.4295	-0.612	-0.2035	-0.0597	-0.7467	-0.1472	0.1082	0.2227	0.01	-0.0648	0.1958	0.1422	0.2461	29.0693	32.9359	23.5444
106	2.3402	0.5822	0.1387	5.1129	-0.9446	4.1616	-0.0095	0.0883	0.1713	-0.18	-0.0578	-0.0936	-0.2992	0.0624	-0.0163	0.1758	-0.0244	-0.0552	0.0821	0.1386	0.2133	32.6953	35.133	31.0765
107	6.7011	0.3524	-5.6382	3.5389	0.577	6.6415	0.0917	0.266	0.7403	-0.4523	0.0169	0.4244	-0.7741	-0.1582	-0.1728	0.2674	-0.0418	-0.0626	0.0756	0.0583	0.3019	35.79	38.8755	36.5579
108	6.4858	-1.0916	-1.427	0.1841	0.2873	5.3356	0.2105	-0.1076	0.371	0.2857	-0.1537	-0.6092	-0.6517	0.5176	-0.0616	0.1325	-0.0478	-0.0287	0.1025	0.0518	0.2106	44.1278	30.9293	36.5514
109	3.8885	2.8727	4.5248	2.1264	3.3827	5.8021	-0.2582	0.1019	0.4295	-0.1018	-0.0745	0.1848	-0.1494	-0.1429	0.1762	0.0894	-0.0018	-0.0081	0.0707	0.0476	0.0832	34.031	22.9473	34.7288
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112	5.6152	5.5915	2.5292	7.8001	0.1491	3.6548	-0.1294	1.4585	-0.0925	-0.9302	-0.0113	-0.7954	0.054	1.286	0.1614	0.1941	0.0215	-0.0056	0.4343	0.0682	0.2121	37.8847	27.9486	23.3408
113	2.7848	0.0248	-1.6174	2.5463	-0.9823	3.3174	-0.0648	0.3259	0.2897	-0.4404	0.0866	-0.3179	-0.0161	0.0969	-0.0386	0.0852	-0.0478	0.0626	0.2736	0.1617	0.1935	44.0156	27.5137	28.7029
114	6.9339	3.7723	4.0994	3.5229	3.2471	3.7058	0.0677	-0.0776	-0.1375	0.1306	-0.2021	0.0974	0.2963	-0.2107	0.1108	0.1142	0.0267	0.0288	0.1091	-0.0107	0.0881	33.0857	18.7222	31.7632
115	9.2538	-4.132	-6.0461	4.4252	1.842	7.963	-0.1744	0.3724	-0.1824	0.0962	0.1717	0.4893	0.1801	-0.2181	0.0195	0.0955	-0.0242	0.0076	0.1391	0.0421	0.1269	15.9207	18.5584	33.4788
116	5.9522	-2.4064	6.9829	3.4331	-2.4537	8.2551	-0.1406	-0.2246	0.2571	-0.1045	-0.0542	0.2209	-0.0072	-0.2997	0.2044	0.0833	0.0084	0.0027	0.142	0.0044	0.1049	21.7583	25.7568	31.2158
117	5.8242	-0.1255	-3.631	4.8696	1.337	3.1661	-0.0543	-0.6966	0.6167	0.4223	0.1754	-0.3156	-0.5064	0.2611	-0.0836	0.2062	0.0257	-0.0921	0.1144	-0.0305	0.1787	36.3234	32.3612	45.3157
118	3.0641	0.7407	0.5669	0.9604	-0.4313	1.5956	0.031	-0.0934	0.5763	0.0823	0.0059	-0.0316	-0.7871	0.0141	-0.0556	0.2572	0.0222	-0.0533	0.042	-0.0364	0.2895	29.6448	36.7914	41.7989
119	6.4728	1.9293	-2.6011	9.0781	1.0914	3.5686	0.04	0.11	-0.1378	-0.0956	0.015	0.2712	0.0916	-0.2166	-0.0951	0.1594	0.0374	-0.0658	0.1521	0.0853	0.2811	20.5048	34.3389	30.9863
120	5.7973	1.3331	-4.9495	3.881	-2.9674	5.1615	-0.0614	-1.1597	0.7345	1.1927	-0.1244	-0.4831	-1.1554	0.3787	0.161	0.4251	0.0702	-0.0634	0.3065	-0.0841	0.4278	18.1977	34.4613	37.7297

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(CHAIN A AND RESID 1:6)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(CHAIN A AND RESID 7:12)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(CHAIN A AND RESID 13:18)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(CHAIN A AND RESID 19:24)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(CHAIN A AND RESID 25:30)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(CHAIN A AND RESID 31:36)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(CHAIN A AND RESID 37:44)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(CHAIN A AND RESID 45:49)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(CHAIN A AND RESID 50:54)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(CHAIN A AND RESID 55:61)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(CHAIN A AND RESID 62:67)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(CHAIN A AND RESID 68:71)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(CHAIN A AND RESID 72:76)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(CHAIN A AND RESID 77:84)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(CHAIN A AND RESID 85:89)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(CHAIN A AND RESID 91:97)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(CHAIN A AND RESID 98:102)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(CHAIN A AND RESID 103:107)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(CHAIN A AND RESID 108:112)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(CHAIN A AND RESID 113:117)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(CHAIN B AND RESID 1:8)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(CHAIN B AND RESID 9:14)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(CHAIN B AND RESID 15:21)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(CHAIN B AND RESID 22:26)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(CHAIN B AND RESID 27:32)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(CHAIN B AND RESID 33:37)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(CHAIN B AND RESID 38:42)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(CHAIN B AND RESID 43:47)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(CHAIN B AND RESID 48:53)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(CHAIN B AND RESID 54:59)
31	X-RAY DIFFRACTION	31	(CHAIN B AND RESID 60:64)
32	X-RAY DIFFRACTION	32	(CHAIN B AND RESID 65:70)
33	X-RAY DIFFRACTION	33	(CHAIN B AND RESID 71:76)
34	X-RAY DIFFRACTION	34	(CHAIN B AND RESID 77:83)
35	X-RAY DIFFRACTION	35	(CHAIN B AND RESID 84:89)
36	X-RAY DIFFRACTION	36	(CHAIN B AND RESID 91:95)
37	X-RAY DIFFRACTION	37	(CHAIN B AND RESID 96:101)
38	X-RAY DIFFRACTION	38	(CHAIN B AND RESID 102:106)
39	X-RAY DIFFRACTION	39	(CHAIN B AND RESID 107:112)
40	X-RAY DIFFRACTION	40	(CHAIN B AND RESID 113:117)
41	X-RAY DIFFRACTION	41	(CHAIN C AND RESID 1:9)
42	X-RAY DIFFRACTION	42	(CHAIN C AND RESID 10:15)
43	X-RAY DIFFRACTION	43	(CHAIN C AND RESID 16:21)
44	X-RAY DIFFRACTION	44	(CHAIN C AND RESID 22:26)
45	X-RAY DIFFRACTION	45	(CHAIN C AND RESID 27:32)
46	X-RAY DIFFRACTION	46	(CHAIN C AND RESID 33:37)
47	X-RAY DIFFRACTION	47	(CHAIN C AND RESID 38:42)
48	X-RAY DIFFRACTION	48	(CHAIN C AND RESID 43:47)
49	X-RAY DIFFRACTION	49	(CHAIN C AND RESID 48:53)
50	X-RAY DIFFRACTION	50	(CHAIN C AND RESID 54:59)
51	X-RAY DIFFRACTION	51	(CHAIN C AND RESID 60:64)
52	X-RAY DIFFRACTION	52	(CHAIN C AND RESID 65:72)
53	X-RAY DIFFRACTION	53	(CHAIN C AND RESID 73:77)
54	X-RAY DIFFRACTION	54	(CHAIN C AND RESID 78:84)
55	X-RAY DIFFRACTION	55	(CHAIN C AND RESID 85:91)
56	X-RAY DIFFRACTION	56	(CHAIN C AND RESID 92:97)
57	X-RAY DIFFRACTION	57	(CHAIN C AND RESID 98:102)
58	X-RAY DIFFRACTION	58	(CHAIN C AND RESID 103:107)
59	X-RAY DIFFRACTION	59	(CHAIN C AND RESID 108:112)
60	X-RAY DIFFRACTION	60	(CHAIN C AND RESID 113:117)
61	X-RAY DIFFRACTION	61	(CHAIN D AND RESID 1:6)
62	X-RAY DIFFRACTION	62	(CHAIN D AND RESID 7:12)
63	X-RAY DIFFRACTION	63	(CHAIN D AND RESID 13:17)
64	X-RAY DIFFRACTION	64	(CHAIN D AND RESID 18:22)
65	X-RAY DIFFRACTION	65	(CHAIN D AND RESID 23:27)
66	X-RAY DIFFRACTION	66	(CHAIN D AND RESID 28:32)
67	X-RAY DIFFRACTION	67	(CHAIN D AND RESID 33:37)
68	X-RAY DIFFRACTION	68	(CHAIN D AND RESID 38:44)
69	X-RAY DIFFRACTION	69	(CHAIN D AND RESID 45:52)
70	X-RAY DIFFRACTION	70	(CHAIN D AND RESID 53:60)
71	X-RAY DIFFRACTION	71	(CHAIN D AND RESID 61:65)
72	X-RAY DIFFRACTION	72	(CHAIN D AND RESID 66:70)
73	X-RAY DIFFRACTION	73	(CHAIN D AND RESID 71:76)
74	X-RAY DIFFRACTION	74	(CHAIN D AND RESID 77:84)
75	X-RAY DIFFRACTION	75	(CHAIN D AND RESID 85:89)
76	X-RAY DIFFRACTION	76	(CHAIN D AND RESID 91:95)
77	X-RAY DIFFRACTION	77	(CHAIN D AND RESID 96:102)
78	X-RAY DIFFRACTION	78	(CHAIN D AND RESID 103:107)
79	X-RAY DIFFRACTION	79	(CHAIN D AND RESID 108:112)
80	X-RAY DIFFRACTION	80	(CHAIN D AND RESID 113:117)
81	X-RAY DIFFRACTION	81	(CHAIN E AND RESID 1:5)
82	X-RAY DIFFRACTION	82	(CHAIN E AND RESID 6:12)
83	X-RAY DIFFRACTION	83	(CHAIN E AND RESID 13:18)
84	X-RAY DIFFRACTION	84	(CHAIN E AND RESID 19:23)
85	X-RAY DIFFRACTION	85	(CHAIN E AND RESID 24:32)
86	X-RAY DIFFRACTION	86	(CHAIN E AND RESID 33:36)
87	X-RAY DIFFRACTION	87	(CHAIN E AND RESID 37:42)
88	X-RAY DIFFRACTION	88	(CHAIN E AND RESID 43:47)
89	X-RAY DIFFRACTION	89	(CHAIN E AND RESID 48:54)
90	X-RAY DIFFRACTION	90	(CHAIN E AND RESID 55:60)
91	X-RAY DIFFRACTION	91	(CHAIN E AND RESID 61:65)
92	X-RAY DIFFRACTION	92	(CHAIN E AND RESID 66:70)
93	X-RAY DIFFRACTION	93	(CHAIN E AND RESID 71:76)
94	X-RAY DIFFRACTION	94	(CHAIN E AND RESID 77:83)
95	X-RAY DIFFRACTION	95	(CHAIN E AND RESID 84:91)
96	X-RAY DIFFRACTION	96	(CHAIN E AND RESID 92:97)
97	X-RAY DIFFRACTION	97	(CHAIN E AND RESID 98:102)
98	X-RAY DIFFRACTION	98	(CHAIN E AND RESID 103:107)
99	X-RAY DIFFRACTION	99	(CHAIN E AND RESID 108:112)
100	X-RAY DIFFRACTION	100	(CHAIN E AND RESID 113:117)
101	X-RAY DIFFRACTION	101	(CHAIN F AND RESID 1:6)
102	X-RAY DIFFRACTION	102	(CHAIN F AND RESID 7:11)
103	X-RAY DIFFRACTION	103	(CHAIN F AND RESID 12:16)
104	X-RAY DIFFRACTION	104	(CHAIN F AND RESID 17:21)
105	X-RAY DIFFRACTION	105	(CHAIN F AND RESID 22:26)
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109	X-RAY DIFFRACTION	109	(CHAIN F AND RESID 43:48)
110	X-RAY DIFFRACTION	110	(CHAIN F AND RESID 49:54)
111	X-RAY DIFFRACTION	111	(CHAIN F AND RESID 55:60)
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113	X-RAY DIFFRACTION	113	(CHAIN F AND RESID 66:71)
114	X-RAY DIFFRACTION	114	(CHAIN F AND RESID 72:76)
115	X-RAY DIFFRACTION	115	(CHAIN F AND RESID 77:84)
116	X-RAY DIFFRACTION	116	(CHAIN F AND RESID 85:92)
117	X-RAY DIFFRACTION	117	(CHAIN F AND RESID 93:102)
118	X-RAY DIFFRACTION	118	(CHAIN F AND RESID 103:107)
119	X-RAY DIFFRACTION	119	(CHAIN F AND RESID 108:112)
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実験情報

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実験

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試料調製

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データ収集

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解析

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)