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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2cht | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG | ||||||
![]() | CHORISMATE MUTASE | ||||||
![]() | ISOMERASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() chorismate metabolic process / chorismate mutase / chorismate mutase activity / aromatic amino acid family biosynthetic process / amino acid biosynthetic process / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Chook, Y.M. / Ke, H. / Lipscomb, W.N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of the monofunctional chorismate mutase from Bacillus subtilis and its complex with a transition state analog. 著者: Chook, Y.M. / Ke, H. / Lipscomb, W.N. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 364.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 300.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 474.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 522.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 32.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 52.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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4 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: ARG H 116 - PRO H 117 OMEGA = 136.77 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 2: ARG J 116 - PRO J 117 OMEGA = 142.62 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION | ||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.40172, 0.7539, 0.51985), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14507.915 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-TSA / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.99 Å3/Da / 溶媒含有率: 38.13 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5.3 / 手法: microdialysis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / Num. obs: 80528 / % possible obs: 75 % / Num. measured all: 208894 / Rmerge(I) obs: 0.055 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.182 / Rfactor obs: 0.182 / 最高解像度: 2.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.2 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.182 / Rfactor Rwork: 0.182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 3.05 |