登録情報 | データベース: PDB / ID: 3wgy |
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タイトル | Crystal structure of meso-dapdh Q154L/T173I/R199M/P248S/H249N/N276S mutant with 4-methyl-2-oxovalerate of from Clostridium tetani E88 |
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要素 | Meso-diaminopimelate dehydrogenase |
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キーワード | OXIDOREDUCTASE / meso-diaminopimelate dehydrogenase / mutation / domain motion / 4-methyl-2-oxovalerate |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
diaminopimelate dehydrogenase / diaminopimelate dehydrogenase activity / diaminopimelate biosynthetic process / lysine biosynthetic process via diaminopimelate / nucleotide binding類似検索 - 分子機能 Diaminopimelate dehydrogenase, Ddh / Meso-diaminopimelate D-dehydrogenase, C-terminal / Diaminopimelic acid dehydrogenase C-terminal domain / Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 / Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Rossmann fold / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 2-OXO-4-METHYLPENTANOIC ACID / Meso-diaminopimelate D-dehydrogenase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Clostridium tetani (破傷風菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Liu, W.D. / Li, Z. / Huang, C.H. / Guo, R.T. / Wu, Q.Q. / Zhu, D.M. |
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引用 | ジャーナル: to be published タイトル: Crystal structure of meso-dapdh Q154L/T173I/R199M/P248S/H249N/N276S mutant with 4-methyl-2-oxovalerate of from Clostridium tetani E88 著者: Liu, W.D. / Li, Z. / Huang, C.H. / Guo, R.T. / Wu, Q.Q. / Zhu, D.M. |
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履歴 | 登録 | 2013年8月19日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2014年8月20日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年11月22日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version |
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改定 1.2 | 2024年3月20日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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