+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3uv0 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Crystal structure of the drosophila MU2 FHA domain | ||||||
![]() | Mutator 2, isoform B | ||||||
![]() | PROTEIN BINDING / FHA / dimerization | ||||||
機能・相同性 | ![]() regulation of pericentric heterochromatin formation / euchromatin => GO:0000791 / regulation of chromatin organization / chromosome, centromeric region / double-strand break repair / transcription coactivator activity 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Luo, S. / Ye, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Dimerization, but not phosphothreonine binding, is conserved between the forkhead-associated domains of Drosophila MU2 and human MDC1 著者: Luo, S. / Ye, K. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 51.1 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 37.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 427.8 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 428.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11062.803 Da / 分子数: 2 / 断片: FHA domain, UNP residues 1-101 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: mu2, Dmel_CG1960 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.49 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.65 % |
---|---|
結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 0.2M Calcium acetate, pH 7.0, 18% PEG 3350, 50mM KCl, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
---|---|
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2009年10月11日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.97947 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.9→25 Å / Num. obs: 20767 |
-
解析
ソフトウェア |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 構造決定の手法: ![]() 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES: REFINED INDIVIDUALLY
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso max: 52.05 Å2 / Biso mean: 18.1713 Å2 / Biso min: 7.13 Å2
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→18.87 Å
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LS精密化 シェル | 解像度: 1.9→1.949 Å / Total num. of bins used: 20
|