PDB-3ubj: Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with li...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3ubj

タイトル

Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand LSTa

要素

(Hemagglutinin ...) x 2

キーワード

VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / viral envelope protein / hemagglutinin / viral fusion protein / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex

機能・相同性

機能・相同性情報

viral budding from plasma membrane / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / host cell surface receptor binding / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / virion membrane / metal ion binding / membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス)

Influenza a virus (A型インフルエンザウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.25 Å

データ登録者

Xu, R. / Wilson, I.A.

引用

ジャーナル: J.Virol. / 年: 2012
タイトル: Structural Characterization of the Hemagglutinin Receptor Specificity from the 2009 H1N1 Influenza Pandemic.
著者: Xu, R. / McBride, R. / Nycholat, C.M. / Paulson, J.C. / Wilson, I.A.

履歴

登録	2011年10月24日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2011年11月23日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2012年1月11日	Group: Database references
改定 1.2	2017年11月8日	Group: Advisory / Refinement description / カテゴリ: pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / software / Item: _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_validate_close_contact / struct_asym / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2023年9月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 2.2	2024年10月9日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3ubj.cif.gz	599.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3ubj.ent.gz	493.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3ubj.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ub/3ubj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ub/3ubj	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3ubeC 3ubnC 3ubqC 3lzgS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3lzg-1 3ube-2 3ubq-2 2wr2-d 2wr0-d 4jug-2 2wr3-d 5t0b-d 3ube-1 6tvf-2 6y5g-d 4m4y-d 2wr4-d 4we9-1 4f3z-d 5t0e-d 4jtv-2 4lxv-1 3ubn-2 4we8-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#76 - 2006年4月赤血球凝集素 (Hemagglutinin) 類似性 (6) #170 - 2014年2月広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies) 類似性 (5) #259 - 2021年7月人工設計タンパク質と市民科学 (Designed Proteins and Citizen Science) 類似性 (5) #62 - 2005年2月主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex) 類似性 (5) #63 - 2005年3月 T細胞受容体 (T-Cell Receptor) 類似性 (5) #200 - 2016年8月正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#76 - 2006年4月
赤血球凝集素 (Hemagglutinin)
類似性 (6)
#170 - 2014年2月
広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies)
類似性 (5)
#259 - 2021年7月
人工設計タンパク質と市民科学 (Designed Proteins and Citizen Science)
類似性 (5)
#62 - 2005年2月
主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex)
類似性 (5)
#63 - 2005年3月
T細胞受容体 (T-Cell Receptor)
類似性 (5)
#200 - 2016年8月
正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Hemagglutinin HA1

B: Hemagglutinin HA2

C: Hemagglutinin HA1

D: Hemagglutinin HA2

E: Hemagglutinin HA1

F: Hemagglutinin HA2

G: Hemagglutinin HA1

H: Hemagglutinin HA2

I: Hemagglutinin HA1

J: Hemagglutinin HA2

K: Hemagglutinin HA1

L: Hemagglutinin HA2

ヘテロ分子

347 kDa, 12 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Hemagglutinin HA1

B: Hemagglutinin HA2

C: Hemagglutinin HA1

D: Hemagglutinin HA2

E: Hemagglutinin HA1

F: Hemagglutinin HA2

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
172 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

G: Hemagglutinin HA1

H: Hemagglutinin HA2

I: Hemagglutinin HA1

J: Hemagglutinin HA2

K: Hemagglutinin HA1

L: Hemagglutinin HA2

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
174 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	66.851, 116.090, 118.397
Angle α, β, γ (deg.)	61.05, 77.00, 80.39
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1

-
Hemagglutinin ... , 2種, 12分子 ACEGIKBDFHJL

#1: タンパク質	Hemagglutinin HA1 分子量: 36535.281 Da / 分子数: 6 / 断片: Ectodomain HA1, residues 18-344 / 変異: G205C, R220C / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス) 株: SW1 A/CALIFORNIA/04/2009 / 遺伝子: HA, hemagglutinin / プラスミド: pFastbac-HT / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 株 (発現宿主): Hi5 / 参照: UniProt: C3W5S1
#2: タンパク質	Hemagglutinin HA2 分子量: 20278.383 Da / 分子数: 6 / 断片: Ectodomain HA2, residues 345-520 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Influenza a virus (A型インフルエンザウイルス) 株: SW1 A/CALIFORNIA/04/2009 / 遺伝子: HA, hemagglutinin / プラスミド: pFASTbac-HT / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 株 (発現宿主): Hi5 / 参照: UniProt: C3W5S1

#1: タンパク質

Hemagglutinin HA1

分子量: 36535.281 Da / 分子数: 6 / 断片: Ectodomain HA1, residues 18-344 / 変異: G205C, R220C / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス)
株: SW1 A/CALIFORNIA/04/2009 / 遺伝子: HA, hemagglutinin / プラスミド: pFastbac-HT / 発現宿主:

Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 株 (発現宿主): Hi5 / 参照: UniProt: C3W5S1

#2: タンパク質

Hemagglutinin HA2

分子量: 20278.383 Da / 分子数: 6 / 断片: Ectodomain HA2, residues 345-520 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Influenza a virus (A型インフルエンザウイルス)
株: SW1 A/CALIFORNIA/04/2009 / 遺伝子: HA, hemagglutinin / プラスミド: pFASTbac-HT / 発現宿主:

Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 株 (発現宿主): Hi5 / 参照: UniProt: C3W5S1

-
糖 , 3種, 19分子

#3: 多糖

2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 424.401 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}	LINUCS	PDB-CARE

#4: 多糖

N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-3)-beta-D-galactopyranose

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 471.411 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DNeup5Aca2-3DGalpb1-ROH	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/2,2,1/[a2112h-1b_1-5][Aad21122h-2a_2-6_5*NCC/3=O]/1-2/a3-b2	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[][D-1-deoxy-Galp]{[(3+2)][a-D-Neup5Ac]{}}	LINUCS	PDB-CARE

#5: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE / N-アセチル-β-D-グルコサミン

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₅NO₆

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

-
非ポリマー , 1種, 783分子

#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 783 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.29 Å³/Da / 溶媒含有率: 46.36 %
結晶化	温度: 295.5 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.8 詳細: 27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 110 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 23-ID-D / 波長: 1.0332 Å

検出器

タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年12月6日

放射

モノクロメーター: double crystal monochromator and K-B pair of biomorph mirrors for vertical and horizontal focusing
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.0332 Å / 相対比: 1

Reflection

冗長度: 2.1 % / Av σ(I) over netI: 9.32 / 数: 274313 / R_merge(I) obs: 0.082 / Χ²: 1.02 / D res high: 2.25 Å / D res low: 50 Å / Num. obs: 131425 / % possible obs: 91

Diffraction reflection shell

最高解像度 (Å)	最低解像度 (Å)	% possible obs (%)	ID	R_merge(I) obs	Chi squared	Redundancy
4.85	50	99.5	1	0.037	0.999	2.2
3.85	4.85	98.9	1	0.041	1.045	2.2
3.36	3.85	98.8	1	0.065	1.057	2.2
3.05	3.36	98.6	1	0.111	1.09	2.2
2.83	3.05	98.2	1	0.174	1.032	2.2
2.67	2.83	96.8	1	0.233	0.99	2.1
2.53	2.67	92	1	0.297	1.031	2
2.42	2.53	84.2	1	0.346	0.982	1.9
2.33	2.42	75.6	1	0.391	0.947	1.8
2.25	2.33	67.5	1	0.434	0.963	1.7

反射

解像度: 2.25→50 Å / Num. obs: 131425 / % possible obs: 91 % / 冗長度: 2.1 % / R_merge(I) obs: 0.082 / Net I/σ(I): 6.9

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Diffraction-ID	% possible all
2.25-2.33	1.7	0.434	1	67.5
2.33-2.42	1.8	0.391	1	75.6
2.42-2.53	1.9	0.346	1	84.2
2.53-2.67	2	0.297	1	92
2.67-2.83	2.1	0.233	1	96.8
2.83-3.05	2.2	0.174	1	98.2
3.05-3.36	2.2	0.111	1	98.6
3.36-3.85	2.2	0.065	1	98.8
3.85-4.85	2.2	0.041	1	98.9
4.85-50	2.2	0.037	1	99.5

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

R_factor: 42.03 / Model details: Phaser MODE: MR_AUTO

	最高解像度	最低解像度
Rotation	2.5 Å	49.32 Å
Translation	2.5 Å	49.32 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER	2.1.4	位相決定
PHENIX	1.7_650	精密化
PDB_EXTRACT	3.1	データ抽出
Blu-Ice		データ収集
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 3LZG

3lzg

解像度: 2.25→49.316 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / SU ML: 0.33 / σ(F): 1.97 / 位相誤差: 29.32 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2524	6522	4.99 %
R_work	0.2015	-	-
obs	0.204	130790	91.04 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.83 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 35.644 Å² / k_sol: 0.35 e/Å³

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-4.6283 Å²	3.2031 Å²	7.3836 Å²
2-	-	2.4958 Å²	13.4355 Å²
3-	-	-	2.2024 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.25→49.316 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	23264	0	376	783	24423

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	24253
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.783	32828
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.728	8913
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.052	3598
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	4196

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.25-2.2756	0.309	144	0.2798	2969	X-RAY DIFFRACTION	65
2.2756-2.3023	0.3896	176	0.2741	3077	X-RAY DIFFRACTION	68
2.3023-2.3304	0.3506	164	0.2695	3155	X-RAY DIFFRACTION	70
2.3304-2.3599	0.3425	186	0.2771	3283	X-RAY DIFFRACTION	73
2.3599-2.391	0.3686	157	0.2773	3541	X-RAY DIFFRACTION	76
2.391-2.4237	0.3509	187	0.2627	3552	X-RAY DIFFRACTION	79
2.4237-2.4584	0.3182	194	0.2593	3704	X-RAY DIFFRACTION	81
2.4584-2.495	0.3268	190	0.2684	3839	X-RAY DIFFRACTION	84
2.495-2.534	0.326	237	0.2626	3942	X-RAY DIFFRACTION	87
2.534-2.5756	0.3318	209	0.2671	4116	X-RAY DIFFRACTION	89
2.5756-2.62	0.3207	194	0.2622	4157	X-RAY DIFFRACTION	92
2.62-2.6676	0.3475	226	0.2544	4341	X-RAY DIFFRACTION	94
2.6676-2.7189	0.3479	237	0.2449	4344	X-RAY DIFFRACTION	96
2.7189-2.7744	0.2858	235	0.2302	4430	X-RAY DIFFRACTION	97
2.7744-2.8347	0.2923	229	0.2189	4421	X-RAY DIFFRACTION	97
2.8347-2.9007	0.2596	249	0.2343	4474	X-RAY DIFFRACTION	98
2.9007-2.9732	0.2834	214	0.2301	4448	X-RAY DIFFRACTION	98
2.9732-3.0536	0.3105	255	0.2204	4475	X-RAY DIFFRACTION	98
3.0536-3.1434	0.2655	236	0.2074	4454	X-RAY DIFFRACTION	98
3.1434-3.2449	0.2432	244	0.2115	4482	X-RAY DIFFRACTION	99
3.2449-3.3608	0.2547	236	0.2026	4498	X-RAY DIFFRACTION	99
3.3608-3.4953	0.2388	249	0.2027	4508	X-RAY DIFFRACTION	99
3.4953-3.6544	0.2491	247	0.182	4422	X-RAY DIFFRACTION	99
3.6544-3.847	0.2125	238	0.1675	4538	X-RAY DIFFRACTION	99
3.847-4.0879	0.1879	253	0.1594	4453	X-RAY DIFFRACTION	99
4.0879-4.4033	0.2016	221	0.1597	4555	X-RAY DIFFRACTION	99
4.4033-4.8461	0.1884	242	0.1494	4485	X-RAY DIFFRACTION	99
4.8461-5.5465	0.214	226	0.17	4556	X-RAY DIFFRACTION	99
5.5465-6.9849	0.244	212	0.1904	4538	X-RAY DIFFRACTION	99
6.9849-49.328	0.2055	235	0.1813	4511	X-RAY DIFFRACTION	99

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
Hemagglutinin ... , 2種, 12分子 ACEGIKBDFHJL

-
糖 , 3種, 19分子

-
非ポリマー , 1種, 783分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
位相決定

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-Hemagglutinin ... , 2種, 12分子 ACEGIKBDFHJL

-糖 , 3種, 19分子

-非ポリマー , 1種, 783分子

-詳細

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-位相決定

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
Hemagglutinin ... , 2種, 12分子 ACEGIKBDFHJL

-
糖 , 3種, 19分子

-
非ポリマー , 1種, 783分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
位相決定

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)