PDB-3sej: Structural characterization of a GII.4 2004 norovirus variant (TC...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3sej

タイトル

Structural characterization of a GII.4 2004 norovirus variant (TCH05) bound to Secretor Lewis HBGA (LeB)

要素

Capsid

キーワード

VIRAL PROTEIN / Protein-Carbohydrate Complex / LeB bound / Receptor binding / Human Blood Group Antigens / Carbohydrate/Sugar binding / Lewis family

機能・相同性

機能・相同性情報

virion component / host cell cytoplasm / metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Norovirus Hu/GII.4/2004/NL (ウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.041 Å

データ登録者

Shanker, S. / Choi, J.-M. / Sankaran, B. / Atmar, R.L. / Estes, M.K. / Prasad, B.V.V.

引用

ジャーナル: J.Virol. / 年: 2011
タイトル: Structural Analysis of Histo-Blood Group Antigen Binding Specificity in a Norovirus GII.4 Epidemic Variant: Implications for Epochal Evolution.
著者: Shanker, S. / Choi, J.M. / Sankaran, B. / Atmar, R.L. / Estes, M.K. / Prasad, B.V.

履歴

登録	2011年6月10日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2011年7月13日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年8月24日	Group: Database references
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_validate_close_contact / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_value_order / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2024年2月28日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ncs_dom_lim Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3sej.cif.gz	1.1 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3sej.ent.gz	990.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3sej.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/se/3sej ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/se/3sej	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3sjpC 3skbC 3sldC 3slnC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4op7-d 5j35-d 7l3q-1 2x8b-d 6nc9-d 7l3q-2 3sld-1 5iyw-d 4x0c-d 4ey8-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#156 - 2012年12月 ABO式血液型糖転移酵素 (ABO Blood Type Glycosyltransferases) 類似性 (4)

登録構造単位

A: Capsid

B: Capsid

C: Capsid

D: Capsid

E: Capsid

F: Capsid

G: Capsid

H: Capsid

I: Capsid

J: Capsid

ヘテロ分子

351 kDa, 10 ポリマー
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1

A: Capsid

C: Capsid

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
70.7 kDa, 2 ポリマー
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2

B: Capsid

E: Capsid

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
70.7 kDa, 2 ポリマー
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3

D: Capsid

F: Capsid

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
70.7 kDa, 2 ポリマー
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4

G: Capsid

J: Capsid

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
70.7 kDa, 2 ポリマー
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5

H: Capsid

ソフトウェアが定義した集合体
34.3 kDa, 1 ポリマー
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6

I: Capsid

ソフトウェアが定義した集合体
34.3 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	242.740, 339.779, 125.021
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	20
Space group name H-M	C222₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
1	2	H
2	2	I
1	3	D
2	3	E
1	4	F
2	4	G
3	4	J

NCSドメイン領域:

Refine code: 4

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	1	THR	THR	GLY	GLY	A	A	224 - 270	4 - 50
2	1	1	THR	THR	GLY	GLY	B	B	224 - 270	4 - 50
3	1	1	THR	THR	GLY	GLY	C	C	224 - 270	4 - 50
1	2	1	LEU	LEU	ALA	ALA	A	A	272 - 304	52 - 84
2	2	1	LEU	LEU	ALA	ALA	B	B	272 - 304	52 - 84
3	2	1	LEU	LEU	ALA	ALA	C	C	272 - 304	52 - 84
1	3	1	GLN	GLN	MET	MET	A	A	306 - 530	86 - 310
2	3	1	GLN	GLN	MET	MET	B	B	306 - 530	86 - 310
3	3	1	GLN	GLN	MET	MET	C	C	306 - 530	86 - 310
1	1	3	LYS	LYS	MET	MET	D	D	225 - 530	5 - 310
2	1	3	LYS	LYS	MET	MET	E	E	225 - 530	5 - 310
1	1	4	LYS	LYS	ARG	ARG	F	F	225 - 411	5 - 191
2	1	4	LYS	LYS	ARG	ARG	G	G	225 - 411	5 - 191
3	1	4	LYS	LYS	ARG	ARG	J	J	225 - 411	5 - 191
1	2	4	SER	SER	GLY	GLY	F	F	413 - 531	193 - 311
2	2	4	SER	SER	GLY	GLY	G	G	413 - 531	193 - 311
3	2	4	SER	SER	GLY	GLY	J	J	413 - 531	193 - 311

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4

#1: タンパク質

Capsid

分子量: 34331.117 Da / 分子数: 10 / 断片: Protruding Domain (UNP Residues 221-531) / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Norovirus Hu/GII.4/2004/NL (ウイルス)
発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q5EGK8

#2: 多糖

alpha-L-fucopyranose-(1-2)-beta-D-galactopyranose-(1-3)-[alpha-L-fucopyranose-(1-4)]2-acetamido-2- ...

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 999.912 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
LFucpa1-2DGalpb1-3[LFucpa1-4]DGlcpNAcb1-3DGalpb1-4DGlcpb1-ROH	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/4,6,5/[a2122h-1b_1-5][a2112h-1b_1-5][a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1221m-1a_1-5]/1-2-3-2-4-4/a4-b1_b3-c1_c3-d1_c4-f1_d2-e1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[][b-D-Glcp]{[(4+1)][b-D-Galp]{[(3+1)][b-D-GlcpNAc]{[(3+1)][b-D-Galp]{[(2+1)][a-L-Fucp]{}}[(4+1)][a-L-Fucp]{}}}}	LINUCS	PDB-CARE

#3: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 457 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

配列の詳細

THESE MUTATIONS ARE STRAIN SPECIFIC AS UNP DOES NOT HAVE THE EXACT STRAIN

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.75 Å³/Da / 溶媒含有率: 67.24 %
結晶化	温度: 295.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 100mM TRIS, 0.8M potassium sodium tartrate, 0.5% w/v PEG monomethyl ether 5000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 5.0.1 / 波長: 0.9765 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2010年6月20日
放射	モノクロメーター: Si(220) Asymmetric cut single crystal プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9765 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.04→50 Å / Num. obs: 98994 / % possible obs: 75 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 7.3 % / R_merge(I) obs: 0.135 / R_sym value: 0.114 / Net I/σ(I): 10.285
反射シェル	解像度: 3.04→3.1 Å / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データ収集
PHASER		位相決定
REFMAC	5.5.0102	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 3.041→49.38 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.935 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.892 / SU B: 30.904 / SU ML: 0.25 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.354 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.22349	4924	5 %	RANDOM
R_work	0.16615	-	-	-
obs	0.16898	94045	99.74 %	-
all	-	98994	-	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 39.905 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.08 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-1.22 Å²	0 Å²
3-	-	-	1.14 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.041→49.38 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	23568	0	544	457	24569

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.018	0.022	24834
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.811	1.983	34059
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	7.349	5	3034
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	36.626	24.255	1121
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	17.982	15	3493
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	20.505	15	120
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.11	0.2	3923
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.008	0.022	19120
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.74	1.5	15247
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.418	2	24853
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.829	3	9587
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	3.244	4.5	9206
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	1	A	2368	MEDIUM POSITIONAL	0.27	0.5
1	2	B	2368	MEDIUM POSITIONAL	0.26	0.5
1	3	C	2368	MEDIUM POSITIONAL	0.34	0.5
1	1	A	2368	MEDIUM THERMAL	0.89	2
1	2	B	2368	MEDIUM THERMAL	0.82	2
1	3	C	2368	MEDIUM THERMAL	0.99	2
2	1	H	2132	MEDIUM POSITIONAL	0.25	0.5
2	1	H	2132	MEDIUM THERMAL	0.9	2
3	1	D	2382	MEDIUM POSITIONAL	0.22	0.5
3	1	D	2382	MEDIUM THERMAL	0.84	2
4	1	F	2360	MEDIUM POSITIONAL	0.24	0.5
4	2	G	2360	MEDIUM POSITIONAL	0.24	0.5
4	3	J	2360	MEDIUM POSITIONAL	0.27	0.5
4	1	F	2360	MEDIUM THERMAL	0.65	2
4	2	G	2360	MEDIUM THERMAL	0.65	2
4	3	J	2360	MEDIUM THERMAL	0.73	2

LS精密化シェル

解像度: 3.041→3.12 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.346	326	-
R_work	0.231	6661	-
obs	-	-	96.47 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.8258	-0.0217	0.065	0.1442	-0.022	0.034	0.0114	-0.0483	0.0607	-0.0552	-0.0365	0.0563	0.0575	0.0081	0.025	0.1369	-0.0005	0.0063	0.053	0.0084	0.0733	93.9016	-61.8489	14.2125
2	27.759	10.1102	16.8218	13.8544	12.9399	14.8917	0.1481	-2.7373	0.0101	0.0643	-0.3939	0.4111	-0.1467	-1.4222	0.2457	0.399	0.2363	0.1223	0.468	0.0717	0.0985	82.2973	-48.2556	16.9808
3	2.225	-0.1431	0.3062	1.8098	0.2973	0.3999	0.0233	0.2105	0.0729	-0.1454	-0.0785	0.0682	0.1172	-0.0112	0.0552	0.0832	-0.0186	-0.0036	0.0482	0.0252	0.0334	82.0246	-53.2748	2.947
4	0.6741	0.174	0.1479	0.282	0.1755	0.1158	-0.0389	0.0603	0.0045	-0.0633	0.0085	0.0454	-0.0377	0.026	0.0304	0.0492	-0.017	-0.0011	0.0972	0.0098	0.015	100.7243	-63.5098	12.2479
5	0.9575	0.5638	0.0322	0.3425	-0.0519	0.5053	-0.0031	-0.0298	-0.1149	-0.0284	-0.027	-0.0677	0.1683	0.0902	0.03	0.0675	0.0197	0.0127	0.0485	-0.0086	0.0651	110.3413	-73.5846	21.8401
6	0.2231	-0.0495	0.163	0.7416	0.0993	0.1652	-0.0275	-0.0228	0.0022	0.0379	0.0051	0.105	-0.063	-0.0334	0.0224	0.1238	0.0116	0.014	0.0867	-0.0529	0.1221	44.9161	-31.9776	8.3479
7	3.6414	6.221	-0.0098	11.0527	0.0116	3.4804	-0.6029	0.0188	0.4108	-1.4739	0.1301	0.6189	0.0792	0.2228	0.4729	0.4646	-0.0539	0.0147	0.0261	0.0117	0.1326	58.7993	-39.2952	2.0374
8	0.7674	0.4742	-0.0984	2.752	1.1231	1.234	0.0542	-0.0557	-0.0557	0.268	-0.0793	-0.0419	0.0578	-0.0288	0.0251	0.0751	0.0063	-0.0762	0.0156	-0.0222	0.117	52.6692	-44.5739	14.8424
9	0.9162	-0.0337	-0.4691	1.4017	0.2148	0.4411	-0.0155	-0.1918	0.0091	0.3251	-0.0412	0.1097	-0.0764	0.0421	0.0568	0.1794	0.0279	-0.027	0.0581	-0.0235	0.0842	49.1055	-41.3627	21.191
10	0.0118	0.0841	-0.0332	2.0762	-0.3426	0.2661	0.0169	0.0274	-0.0082	0.1594	0.0741	0.3114	-0.143	-0.0574	-0.0911	0.1074	0.0203	0.0377	0.0795	-0.0527	0.1444	38.5885	-19.6381	6.8293
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19	X-RAY DIFFRACTION	19	D	383 - 483
20	X-RAY DIFFRACTION	20	D	484 - 531
21	X-RAY DIFFRACTION	21	E	222 - 304
22	X-RAY DIFFRACTION	22	E	305 - 315
23	X-RAY DIFFRACTION	23	E	316 - 376
24	X-RAY DIFFRACTION	24	E	377 - 483
25	X-RAY DIFFRACTION	25	E	484 - 530
26	X-RAY DIFFRACTION	26	F	224 - 286
27	X-RAY DIFFRACTION	27	F	287 - 316
28	X-RAY DIFFRACTION	28	F	317 - 407
29	X-RAY DIFFRACTION	29	F	408 - 503
30	X-RAY DIFFRACTION	30	F	504 - 531
31	X-RAY DIFFRACTION	31	G	224 - 286
32	X-RAY DIFFRACTION	32	G	287 - 316
33	X-RAY DIFFRACTION	33	G	317 - 409
34	X-RAY DIFFRACTION	34	G	410 - 415
35	X-RAY DIFFRACTION	35	G	416 - 531
36	X-RAY DIFFRACTION	36	H	221 - 281
37	X-RAY DIFFRACTION	37	H	282 - 345
38	X-RAY DIFFRACTION	38	H	346 - 407
39	X-RAY DIFFRACTION	39	H	408 - 476
40	X-RAY DIFFRACTION	40	H	477 - 531
41	X-RAY DIFFRACTION	41	I	221 - 280
42	X-RAY DIFFRACTION	42	I	281 - 316
43	X-RAY DIFFRACTION	43	I	317 - 369
44	X-RAY DIFFRACTION	44	I	375 - 404
45	X-RAY DIFFRACTION	45	I	405 - 530
46	X-RAY DIFFRACTION	46	J	225 - 286
47	X-RAY DIFFRACTION	47	J	287 - 316
48	X-RAY DIFFRACTION	48	J	317 - 406
49	X-RAY DIFFRACTION	49	J	407 - 483
50	X-RAY DIFFRACTION	50	J	484 - 531

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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