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Yorodumi- PDB-3sld: Structural characterization of a GII.4 2004 norovirus variant (TC... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3sld | |||||||||
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Title | Structural characterization of a GII.4 2004 norovirus variant (TCH05) bound to A trisaccharide | |||||||||
Components | Capsid | |||||||||
Keywords | VIRAL PROTEIN / HBGA binding domain / HBGA | |||||||||
Function / homology | Function and homology information | |||||||||
Biological species | Norovirus Hu/GII.4/2004/NL | |||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.679 Å | |||||||||
Authors | Shanker, S. / Choi, J.-M. / Sankaran, B. / Atmar, R.L. / Estes, M.K. / Prasad, B.V.V. | |||||||||
Citation | Journal: J.Virol. / Year: 2011 Title: Structural Analysis of Histo-Blood Group Antigen Binding Specificity in a Norovirus GII.4 Epidemic Variant: Implications for Epochal Evolution. Authors: Shanker, S. / Choi, J.M. / Sankaran, B. / Atmar, R.L. / Estes, M.K. / Prasad, B.V. | |||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3sld.cif.gz | 1.1 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb3sld.ent.gz | 979.7 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3sld.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 3sld_validation.pdf.gz | 3.4 MB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 3sld_full_validation.pdf.gz | 3.4 MB | Display | |
Data in XML | 3sld_validation.xml.gz | 116 KB | Display | |
Data in CIF | 3sld_validation.cif.gz | 161.6 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sl/3sld ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sl/3sld | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 3sejC 3sjpSC 3skbC 3slnC C: citing same article (ref.) S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
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-Assembly
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Refine code: 4
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