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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3s6s | ||||||
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タイトル | Ancylostoma-secreted protein Ac-ASP-7 | ||||||
![]() | Ac-ASP-7 | ||||||
![]() | UNKNOWN FUNCTION / Pathogenesis-related Protein / SCP/TAPS | ||||||
機能・相同性 | Pathogenesis-related Protein p14a / CAP / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Osman, A. / Wang, C.K. / Winter, A. / Loukas, A. / Tribolet, L. / Gasser, R. / Hofmann, A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Hookworm SCP/TAPS protein structure--A key to understanding host-parasite interactions and developing new interventions. 著者: Osman, A. / Wang, C.K. / Winter, A. / Loukas, A. / Tribolet, L. / Gasser, R.B. / Hofmann, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 76.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 61.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 23511.436 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | 配列の詳細 | AS PER THE THE AUTHORS THERE IS AN UNEXPLAINED SEQUENCE MISMATCH BETWEEN THE GENBANK SEQUENCE AND ...AS PER THE THE AUTHORS THERE IS AN UNEXPLAINE | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.37 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.12 % |
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結晶化 | 温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7 詳細: 20% MPD, 0.1 M TRIS, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2010年11月10日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.93224 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.4→61 Å / Num. obs: 18132 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 7 % / Biso Wilson estimate: 44.5 Å2 / Rsym value: 0.074 |
反射 シェル | 解像度: 2.4→2.53 Å / 冗長度: 7.2 % / Mean I/σ(I) obs: 5.8 / Num. unique all: 2591 / Rsym value: 0.26 / % possible all: 100 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.83 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 43.188 Å2 / ksol: 0.344 e/Å3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→60 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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