温度: 293 K / pH: 7.5 詳細: 2 uL of protein solution(15-20 mg/ml, 50 mM TEA, pH 7.5, 100 mM KCL, 2 mM DTT, 10 mM deaza-PLP, 50 mM L-aspartate) mixed with 2 uL reservoir buffer (53-60% saturated ammonium sulfate and 50 ...詳細: 2 uL of protein solution(15-20 mg/ml, 50 mM TEA, pH 7.5, 100 mM KCL, 2 mM DTT, 10 mM deaza-PLP, 50 mM L-aspartate) mixed with 2 uL reservoir buffer (53-60% saturated ammonium sulfate and 50 mM TEA, pH 7.5), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
-
データ収集
放射光源
由来: シンクロトロン / サイト: SSRL / ビームライン: BL9-2
検出器
タイプ: MARMOSAIC 325 mm CCD / 検出器: CCD
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
相対比: 1
反射
解像度: 1.79→28.5 Å / Num. obs: 46701 / % possible obs: 98.2 % / 冗長度: 3.4 % / Rsym value: 0.059 / Net I/σ(I): 17.5
-
位相決定
位相決定
手法: 分子置換
Phasing MR
Rfactor: 35.27 / Model details: Phaser MODE: MR_AUTO
最高解像度
最低解像度
Rotation
2.5 Å
38.36 Å
Translation
2.5 Å
38.36 Å
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
DENZO
データ削減
SCALA
データスケーリング
PHASER
2.1.4
位相決定
PHENIX
1.6.4_486
精密化
PDB_EXTRACT
3.1
データ抽出
MOLREP
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.79→28.5 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.22 / SU ML: 0.16 / σ(F): 1.34 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.179
2368
5.07 %
Rwork
0.148
-
-
obs
0.149
46680
97.4 %
溶媒の処理
減衰半径: 0.89 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 50.66 Å2 / ksol: 0.4 e/Å3