PDB-3q15: Crystal Structure of RapH complexed with Spo0F

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3q15

タイトル

Crystal Structure of RapH complexed with Spo0F

要素

Response regulator aspartate phosphatase H
Sporulation initiation phosphotransferase F

キーワード

HYDROLASE/KINASE / Tetratricopeptide repeat / 3-helix bundle / Phosphorelay signal transduction / Phosphatase / Response regulator receiver / HYDROLASE-KINASE complex

機能・相同性

機能・相同性情報

転移酵素; リンを含む基を移すもの / establishment of competence for transformation / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 1価のリン酸エステル加水分解酵素 / sporulation resulting in formation of a cellular spore / phosphoprotein phosphatase activity / phosphorelay signal transduction system / kinase activity / metal ion binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Bacillus subtilis (枯草菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

単波長異常分散 / 解像度: 2.192 Å

データ登録者

Parashar, V. / Neiditch, M.B.

引用

ジャーナル: Plos Biol. / 年: 2011
タイトル: Structural basis of response regulator dephosphorylation by Rap phosphatases.
著者: Parashar, V. / Mirouze, N. / Dubnau, D.A. / Neiditch, M.B.

履歴

登録	2010年12月16日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2011年2月23日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2024年2月21日	Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3q15.cif.gz	399.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3q15.ent.gz	333.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3q15.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3q15_validation.pdf.gz	485.6 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3q15_full_validation.pdf.gz	504.4 KB	表示
XML形式データ	3q15_validation.xml.gz	35.7 KB	表示
CIF形式データ	3q15_validation.cif.gz	49.4 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/q1/3q15 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/q1/3q15	HTTPS FTP

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関連構造データ

類似構造データ	3nhq-4 4az5-1 1jg8-d 2fm1-d 5x2h-d 3c2w-2 3c2w-3 1orr-d 4our-d 1yoe-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#230 - 2019年2月開始因子eIF4E (Initiation Factor eIF4E) 類似性 (5) #190 - 2015年10月 2つの要素で構成される検知・応答系 (Two-component Systems) 類似性 (5) #141 - 2011年9月 O-GlcNAc転移酵素 (O-GlcNAc Transferase) 類似性 (4) #166 - 2013年10月プロテアソーム (Proteasome) 類似性 (3) #97 - 2008年1月概日体内時計タンパク質 (Circadian Clock Proteins) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#230 - 2019年2月
開始因子eIF4E (Initiation Factor eIF4E)
類似性 (5)
#190 - 2015年10月
2つの要素で構成される検知・応答系 (Two-component Systems)
類似性 (5)
#141 - 2011年9月
O-GlcNAc転移酵素 (O-GlcNAc Transferase)
類似性 (4)
#166 - 2013年10月
プロテアソーム (Proteasome)
類似性 (3)
#97 - 2008年1月
概日体内時計タンパク質 (Circadian Clock Proteins)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Response regulator aspartate phosphatase H

B: Response regulator aspartate phosphatase H

C: Sporulation initiation phosphotransferase F

D: Sporulation initiation phosphotransferase F

ヘテロ分子

118 kDa, 4 ポリマー
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1

A: Response regulator aspartate phosphatase H

C: Sporulation initiation phosphotransferase F

ヘテロ分子

A: Response regulator aspartate phosphatase H

C: Sporulation initiation phosphotransferase F

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
118 kDa, 4 ポリマー
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2

B: Response regulator aspartate phosphatase H

D: Sporulation initiation phosphotransferase F

ヘテロ分子

B: Response regulator aspartate phosphatase H

D: Sporulation initiation phosphotransferase F

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
118 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	95.064, 157.452, 84.715
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 110.57, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	B-407- HOH

-
タンパク質 , 2種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質	Response regulator aspartate phosphatase H / PSP28 分子量: 44204.363 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bacillus subtilis (枯草菌) / 遺伝子: BSU06830, rapH, yeeH, yzqA / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) 参照: UniProt: Q59HN8, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素
#2: タンパク質	Sporulation initiation phosphotransferase F / Stage 0 sporulation protein F 分子量: 14388.789 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bacillus subtilis (枯草菌) / 遺伝子: BSU37130, spo0F / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) 参照: UniProt: P06628, 転移酵素; リンを含む基を移すもの

#1: タンパク質

Response regulator aspartate phosphatase H / PSP28

分子量: 44204.363 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Bacillus subtilis (枯草菌) / 遺伝子: BSU06830, rapH, yeeH, yzqA / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)
参照: UniProt: Q59HN8, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素

#2: タンパク質

Sporulation initiation phosphotransferase F / Stage 0 sporulation protein F

分子量: 14388.789 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Bacillus subtilis (枯草菌) / 遺伝子: BSU37130, spo0F / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)
参照: UniProt: P06628, 転移酵素; リンを含む基を移すもの

-
非ポリマー , 4種, 242分子

#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#5: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 236 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.53 Å³/Da / 溶媒含有率: 51.43 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: 20% [w/v] PEG 3350, 200 mM lithium sulphate, and 100 mM Bis-Tris (pH 6.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: NSLS / ビームライン: X29A / 波長: 1.075 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2009年10月2日
放射	モノクロメーター: Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.075 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.2→50 Å / Num. obs: 58465 / Observed criterion σ(I): 1.8 / 冗長度: 3.69 %
反射シェル	解像度: 2.2→2.24 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データ収集
PHASER		位相決定
PHENIX	(phenix.refine: 1.6.4_486)	精密化
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

単波長異常分散 / 解像度: 2.192→31.246 Å / SU ML: 0.35 / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2683	3408	6.21 %	Random
R_work	0.2203	-	-	-
obs	0.2234	54906	92.09 %	-
all	-	54906	-	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.95 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 49.994 Å² / k_sol: 0.357 e/Å³

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	8.0083 Å²	0 Å²	-16.7902 Å²
2-	-	-6.4788 Å²	0 Å²
3-	-	-	-1.5296 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.192→31.246 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	7521	0	24	236	7781

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.004	7704
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.548	10373
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.741	2876
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.042	1127
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.002	1314

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.1921-2.2234	0.3353	88	0.3028	1846	X-RAY DIFFRACTION	78
2.2234-2.2566	0.314	125	0.2869	1956	X-RAY DIFFRACTION	85
2.2566-2.2918	0.3044	149	0.2698	1996	X-RAY DIFFRACTION	85
2.2918-2.3294	0.3517	136	0.2748	1928	X-RAY DIFFRACTION	85
2.3294-2.3695	0.3682	161	0.2702	2007	X-RAY DIFFRACTION	88
2.3695-2.4126	0.3191	114	0.2663	2097	X-RAY DIFFRACTION	89
2.4126-2.459	0.337	149	0.2697	2095	X-RAY DIFFRACTION	91
2.459-2.5092	0.3127	129	0.276	2150	X-RAY DIFFRACTION	91
2.5092-2.5637	0.3193	132	0.252	2135	X-RAY DIFFRACTION	92
2.5637-2.6233	0.3527	136	0.2516	2143	X-RAY DIFFRACTION	92
2.6233-2.6889	0.3211	133	0.2526	2180	X-RAY DIFFRACTION	94
2.6889-2.7615	0.3059	151	0.2446	2186	X-RAY DIFFRACTION	94
2.7615-2.8427	0.2696	149	0.2516	2219	X-RAY DIFFRACTION	96
2.8427-2.9344	0.2789	152	0.2316	2255	X-RAY DIFFRACTION	97
2.9344-3.0392	0.2947	156	0.2415	2260	X-RAY DIFFRACTION	97
3.0392-3.1608	0.2969	155	0.2417	2284	X-RAY DIFFRACTION	98
3.1608-3.3045	0.2806	156	0.2372	2290	X-RAY DIFFRACTION	99
3.3045-3.4785	0.3055	155	0.2214	2315	X-RAY DIFFRACTION	99
3.4785-3.6961	0.263	156	0.2102	2317	X-RAY DIFFRACTION	99
3.6961-3.981	0.2154	155	0.1916	2267	X-RAY DIFFRACTION	98
3.981-4.3807	0.2035	148	0.1738	2233	X-RAY DIFFRACTION	96
4.3807-5.0123	0.2241	144	0.1732	2166	X-RAY DIFFRACTION	93
5.0123-6.3064	0.2664	153	0.2094	2298	X-RAY DIFFRACTION	98
6.3064-31.2487	0.2489	126	0.2203	1875	X-RAY DIFFRACTION	79

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.1067	-1.0934	-0.5777	4.158	-1.6022	3.1432	0.0407	0.5702	0.1483	-0.1591	-0.1552	-0.4052	-0.0611	0.3454	0.0001	0.4331	0.0962	0.1425	0.5318	0.0042	0.368	45.1544	120.4959	15.7227
2	0.0414	-0.0249	0.0664	0.0587	-0.0013	0.0099	-0.7375	-0.1843	-0.8555	0.8492	0.2343	-0.738	0.642	0.4247	-0.0014	0.7111	0.1142	0.0432	0.6562	-0.0602	1.0564	43.9856	101.8411	12.3271
3	0.0016	-0.032	-0.0976	-0.009	0.0947	0.0697	-1.0556	-0.0839	0.4637	-1.3162	0.7762	0.6439	0.8962	0.1735	-0.0001	0.5591	0.0284	0.0134	0.5427	-0.1205	0.9421	32.5474	102.7666	16.2315
4	0.3616	-0.0618	-0.1826	0.1521	0.2343	0.5349	0.1264	-0.1509	-0.6276	0.6337	-0.0545	0.0642	1.1186	-0.1292	0.0003	0.6519	0.0865	0.0768	0.4302	0.0034	0.5766	41.0272	108.0421	25.8081
5	1.483	-1.1938	0.2723	1.0173	1.0991	1.4177	-0.3034	0.1123	0.0772	0.1767	0.1294	0.0064	0.2259	-0.0741	0.0001	0.5808	0.0875	0.0641	0.3665	0.0161	0.3304	36.3956	128.511	28.4892
6	0.1131	-0.0693	-0.0971	0.0506	0.0379	0.0557	0.1287	-0.2915	-2.3553	0.2005	-0.2879	0.2483	0.4373	0.3456	-0.0006	1.1009	0.3437	-0.0153	0.5565	-0.0621	0.8704	45.2856	116.6507	38.2202
7	1.7568	-0.0177	0.8111	0.5177	0.6955	1.7002	-0.0654	0.4138	0.1375	0.1357	-0.125	-0.045	0.418	0.4039	-0	0.4831	0.0238	0.0789	0.4165	0.032	0.3404	41.339	133.3338	38.1553
8	-0.0299	-0.067	-0.1562	0.0978	-0.099	0.0681	0.4579	-0.361	-0.5452	1.6735	0.0963	-0.4931	2.0312	0.9091	0.0003	1.0954	0.386	-0.0702	0.5586	-0.0185	0.3772	48.8982	127.9764	45.7177
9	1.9893	0.8098	-0.2911	0.3268	-0.4469	1.9883	0.456	-0.0144	0.2421	-0.1285	-0.2678	-0.4536	0.2864	0.5998	0.0001	0.5547	0.0965	-0.0468	0.4129	0.032	0.4503	49.6138	138.0462	43.6753
10	0.1469	0.2061	0.3441	0.5021	-0.2656	0.7086	-0.1138	0.3714	0.0578	0.8112	-0.423	-0.3688	-0.176	0.0674	-0	0.4353	0.044	-0.0531	0.4933	0.05	0.466	52.3143	143.2637	50.0861
11	0.0669	0.1142	0.0845	0.1681	-0.1108	0.053	-0.094	-1.7695	-0.4821	0.8737	-0.8635	-0.7223	-0.0913	1.2943	0.0007	0.7214	0.3266	-0.2578	1.0642	0.0616	0.8149	63.951	137.1931	46.7158
12	0.9772	0.9695	1.1205	1.3419	0.229	1.0693	0.2658	0.0316	0.1048	-0.5476	-0.3123	0.0709	0.0682	0.9846	-0	0.4661	0.088	0.0675	0.6551	0.1042	0.4405	58.8218	146.1287	42.0614
13	0.1763	0.0785	-0.2003	-0.039	-0.0051	0.1502	-0.7701	-0.6135	0.8047	0.5641	-0.0126	0.0281	0.1821	0.8412	-0.0008	0.694	-0.1382	-0.1706	0.6237	0.0003	0.9253	52.9954	156.9286	49.7077
14	0.6127	-0.4177	0.0451	0.579	-0.1667	0.2073	0.1113	0.114	0.2104	0.4232	-0.135	-0.6961	0.6288	0.8618	-0.0001	0.4948	0.0004	-0.0036	0.8748	0.1631	0.6099	64.3496	151.7932	39.3092
15	1.7354	-0.2676	0.4752	1.9086	-1.3157	1.5308	0.0572	0.0885	0.2555	0.2953	-0.0561	-0.2638	-0.2534	0.6469	0	0.4348	-0.0679	-0.0176	0.5673	0.0947	0.5707	58.2786	161.9483	35.3738
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59	0.002	-0.0123	-0.007	-0.0033	-0.0188	-0.0077	0.3	-0.0939	0.1035	0.2049	-0.2045	0.3582	-0.0988	0.4726	0	0.9813	0.0575	0.1842	1.0979	-0.1627	1.3925	68.7236	106.0381	18.9407
60	0.0519	0.0509	0.054	0.0295	-0.0139	0.026	-0.0114	-1.1359	-1.3081	0.8101	0.1175	-1.0236	0.7301	0.4785	0.0007	0.5226	0.438	0.0729	0.9282	0.203	0.8354	28.4288	67.018	17.1638
61	0.0804	-0.1438	0.0442	0.0498	0.0777	0.1122	-0.8209	1.1835	0.384	-2.4575	0.5877	1.9354	-0.6653	-0.1648	-0.0022	0.8922	-0.0603	-0.2926	0.8064	0.1765	0.7896	21.4638	79.8954	12.4473
62	0.0542	-0.0205	0.0599	0.0732	0.0063	-0.005	-1.0828	0.9643	0.9453	0.9718	-0.7465	-1.1403	-0.6562	0.9515	0.0023	0.5438	0.1643	-0.0713	0.7018	0.0854	0.7773	22.6943	74.2688	8.7773
63	0.0008	-0.0002	-0.0384	0.02	0.0324	0.0448	-0.2599	-0.7988	-0.6367	-0.1569	0.2516	1.0121	0.1649	-0.0453	0.0001	1.018	0.3483	-0.0424	0.9253	0.041	1.016	25.7104	66.1366	6.8465
64	0.0036	-0.0282	0.004	0.0389	0.0697	0.0352	-0.5609	0.3213	-0.9185	-0.6506	0.2098	-0.0314	0.8041	0.3597	-0.0001	1.0412	0.3782	-0.0705	0.8558	0.0474	1.103	27.8293	63.0949	11.7593
65	0.082	0.0839	-0.1588	0.144	-0.1416	0.0291	-0.0346	0.2767	-0.4318	-0.2679	0.3552	0.5842	0.4467	0.4808	-0.0003	0.4443	0.0991	0.0015	1.0217	-0.0681	0.5985	21.5314	74.5141	18.8576
66	-0.033	-0.0014	0.0367	0.0624	0.0808	0.0623	0.1564	-1.2715	-0.8219	0.3926	-0.5593	-0.3627	0.2707	1.5951	0.0005	0.3986	0.0081	0.2352	0.8603	0.2125	0.4933	22.8989	73.6613	25.9591
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69	0.0694	-0.1374	-0.0235	0.15	0.123	-0.0091	-1.4153	-0.088	-0.5521	1.2183	-0.176	-0.7176	-0.5049	1.4882	0	0.7083	-0.082	-0.031	0.9511	0.1493	0.7489	25.9356	86.2686	19.0899
70	-0.0051	-0.0193	-0.0026	0.0093	0.0679	0.0262	-0.4859	-1.1241	0.6506	0.4393	-0.4159	0.9806	-1.2324	0.2024	-0.0009	1.0742	-0.2557	0.1394	1.1275	-0.0669	1.178	30.7339	83.961	24.2453
71	0.0384	0.0011	-0.011	-0.0097	0.0065	0.03	0.2192	-1.5303	0.6868	-0.0097	-1.2242	-0.1436	0.2146	1.0048	-0.0003	0.7438	0.1229	-0.0368	2.5049	-0.4809	0.8455	31.8677	78.044	29.2936
72	0.0284	-0.0005	-0.0108	-0.0132	0.0003	0.004	0.6301	-0.1191	0.9441	-0.141	-0.169	-1.843	0.4506	0.8996	0.0023	0.6631	0.2298	0.1312	2.779	0.7066	0.9644	35.3652	70.1334	28.6649
73	0.1127	0.0116	0.0239	0.0749	0.1304	0.1389	0.2905	-0.8662	0.3948	-0.4031	-0.6554	-0.8396	-0.0484	1.7195	-0.0001	0.5763	0.0894	-0.0025	1.0139	0.0665	0.8021	34.9124	76.9797	16.3254
74	0.0179	0.0571	0.0003	0.0087	-0.061	-0.0177	-0.0355	0.0193	-1.6579	-1.1776	0.6129	-0.6908	-0.3764	1.4165	0.0001	0.7086	-0.0389	-0.0602	1.28	0.1105	1.1113	36.9657	79.2713	11.5988
75	-0.016	-0.0063	-0.0075	0.0352	-0.0297	0.004	-0.2475	0.6209	-1.2312	0.0223	-0.7328	-0.3058	0.0267	0.5847	0.0007	1.0147	0.2816	0.2251	1.7391	0.1139	1.05	33.0572	75.7703	2.8339
76	0.077	-0.044	0.108	0.0091	-0.0295	0.086	-0.5073	0.1609	-1.3119	-0.9062	0.0368	-1.4672	-0.3655	2.2243	-0.0001	0.8483	0.3105	0.105	1.0939	-0.0672	1.1883	38.1646	69.1129	9.5043

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain A and resid 4:64)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain A and resid 65:69)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain A and resid 77:83)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain A and resid 84:98)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain A and resid 99:128)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain A and resid 129:136)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain A and resid 137:161)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain A and resid 162:171)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain A and resid 172:196)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(chain A and resid 197:207)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain A and resid 208:213)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain A and resid 214:231)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain A and resid 232:238)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain A and resid 239:258)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(chain A and resid 259:290)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(chain A and resid 291:295)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(chain A and resid 296:324)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(chain A and resid 325:329)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(chain A and resid 330:364)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(chain A and resid 365:376)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(chain B and resid 4:11)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(chain B and resid 12:20)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(chain B and resid 21:26)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(chain B and resid 46:50)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(chain B and resid 51:60)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(chain B and resid 61:102)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(chain B and resid 103:122)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(chain B and resid 123:141)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(chain B and resid 142:163)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(chain B and resid 164:206)
31	X-RAY DIFFRACTION	31	(chain B and resid 207:218)
32	X-RAY DIFFRACTION	32	(chain B and resid 219:234)
33	X-RAY DIFFRACTION	33	(chain B and resid 235:240)
34	X-RAY DIFFRACTION	34	(chain B and resid 241:259)
35	X-RAY DIFFRACTION	35	(chain B and resid 260:273)
36	X-RAY DIFFRACTION	36	(chain B and resid 274:291)
37	X-RAY DIFFRACTION	37	(chain B and resid 295:312)
38	X-RAY DIFFRACTION	38	(chain B and resid 313:320)
39	X-RAY DIFFRACTION	39	(chain B and resid 321:358)
40	X-RAY DIFFRACTION	40	(chain B and resid 359:376)
41	X-RAY DIFFRACTION	41	(chain C and resid 4:10)
42	X-RAY DIFFRACTION	42	(chain C and resid 11:15)
43	X-RAY DIFFRACTION	43	(chain C and resid 16:21)
44	X-RAY DIFFRACTION	44	(chain C and resid 22:28)
45	X-RAY DIFFRACTION	45	(chain C and resid 29:34)
46	X-RAY DIFFRACTION	46	(chain C and resid 35:41)
47	X-RAY DIFFRACTION	47	(chain C and resid 42:46)
48	X-RAY DIFFRACTION	48	(chain C and resid 47:54)
49	X-RAY DIFFRACTION	49	(chain C and resid 55:60)
50	X-RAY DIFFRACTION	50	(chain C and resid 61:67)
51	X-RAY DIFFRACTION	51	(chain C and resid 68:72)
52	X-RAY DIFFRACTION	52	(chain C and resid 73:77)
53	X-RAY DIFFRACTION	53	(chain C and resid 78:83)
54	X-RAY DIFFRACTION	54	(chain C and resid 84:88)
55	X-RAY DIFFRACTION	55	(chain C and resid 89:93)
56	X-RAY DIFFRACTION	56	(chain C and resid 94:101)
57	X-RAY DIFFRACTION	57	(chain C and resid 102:106)
58	X-RAY DIFFRACTION	58	(chain C and resid 107:113)
59	X-RAY DIFFRACTION	59	(chain C and resid 114:119)
60	X-RAY DIFFRACTION	60	(chain D and resid 4:8)
61	X-RAY DIFFRACTION	61	(chain D and resid 9:13)
62	X-RAY DIFFRACTION	62	(chain D and resid 14:20)
63	X-RAY DIFFRACTION	63	(chain D and resid 21:25)
64	X-RAY DIFFRACTION	64	(chain D and resid 26:30)
65	X-RAY DIFFRACTION	65	(chain D and resid 31:36)
66	X-RAY DIFFRACTION	66	(chain D and resid 37:44)
67	X-RAY DIFFRACTION	67	(chain D and resid 45:49)
68	X-RAY DIFFRACTION	68	(chain D and resid 50:54)
69	X-RAY DIFFRACTION	69	(chain D and resid 55:60)
70	X-RAY DIFFRACTION	70	(chain D and resid 61:66)
71	X-RAY DIFFRACTION	71	(chain D and resid 67:71)
72	X-RAY DIFFRACTION	72	(chain D and resid 72:76)
73	X-RAY DIFFRACTION	73	(chain D and resid 77:82)
74	X-RAY DIFFRACTION	74	(chain D and resid 99:104)
75	X-RAY DIFFRACTION	75	(chain D and resid 105:109)
76	X-RAY DIFFRACTION	76	(chain D and resid 110:119)

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