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Yorodumi- PDB-3p0j: Leishmania major Tyrosyl-tRNA synthetase in complex with tyrosino... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3p0j | ||||||
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Title | Leishmania major Tyrosyl-tRNA synthetase in complex with tyrosinol, triclinic crystal form 1 | ||||||
Components | Tyrosyl-tRNA synthetase | ||||||
Keywords | LIGASE / aminoacyl-tRNA synthetase / tRNA ligase / aaRS / TyrRS / pseudodimer / translation / ATP-binding / nucleotide-binding / Structural Genomics / Medical Structural Genomics of Pathogenic Protozoa / MSGPP | ||||||
Function / homology | Function and homology information tyrosyl-tRNA aminoacylation / tyrosine-tRNA ligase / tyrosine-tRNA ligase activity / ciliary plasm / ATP binding / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Leishmania major (eukaryote) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / molecular replacement / Resolution: 2.89 Å | ||||||
Authors | Larson, E.T. / Merritt, E.A. / Medical Structural Genomics of Pathogenic Protozoa (MSGPP) | ||||||
Citation | Journal: J.Mol.Biol. / Year: 2011 Title: The Double-Length Tyrosyl-tRNA Synthetase from the Eukaryote Leishmania major Forms an Intrinsically Asymmetric Pseudo-Dimer. Authors: Larson, E.T. / Kim, J.E. / Castaneda, L.J. / Napuli, A.J. / Zhang, Z. / Fan, E. / Zucker, F.H. / Verlinde, C.L. / Buckner, F.S. / Van Voorhis, W.C. / Hol, W.G. / Merritt, E.A. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3p0j.cif.gz | 428.1 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb3p0j.ent.gz | 338.9 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3p0j.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 3p0j_validation.pdf.gz | 490.2 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 3p0j_full_validation.pdf.gz | 550.2 KB | Display | |
Data in XML | 3p0j_validation.xml.gz | 79.3 KB | Display | |
Data in CIF | 3p0j_validation.cif.gz | 110.1 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/p0/3p0j ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/p0/3p0j | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 3p0hSC 3p0iC S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
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