登録情報 | データベース: PDB / ID: 3oor |
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タイトル | I-SceI mutant (K86R/G100T)complexed with C/G+4 DNA substrate |
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要素 | - 5'-D(*CP*AP*CP*GP*CP*TP*AP*GP*GP*GP*AP*TP*AP*AP*CP*CP*GP*GP*GP*TP*AP*AP*TP*AP*C)-3'
- 5'-D(*GP*GP*TP*AP*TP*TP*AP*CP*CP*CP*GP*GP*TP*TP*AP*TP*CP*CP*CP*TP*AP*GP*CP*GP*T)-3'
- Intron encoded endonuclease I-SceI
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キーワード | HYDROLASE/DNA / homing endonuclease / intron homing / LAGLIDADG / Hydrolase-DNA complex / I-SceI mutant (K86R/G100T) |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
intron homing / RNA splicing / mRNA processing / endonuclease activity / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / mitochondrion類似検索 - 分子機能 : / LAGLIDADG DNA endonuclease family / Homing endonucleases / Endonuclease I-creI / Homing endonuclease, LAGLIDADG / Homing endonuclease / Roll / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / Intron-encoded endonuclease I-SceI類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.5 Å |
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データ登録者 | Joshi, R. / Chen, J.-H. / Golden, B.L. / Gimble, F.S. |
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引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2011 タイトル: Evolution of I-SceI Homing Endonucleases with Increased DNA Recognition Site Specificity. 著者: Joshi, R. / Ho, K.K. / Tenney, K. / Chen, J.H. / Golden, B.L. / Gimble, F.S. |
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履歴 | 登録 | 2010年8月31日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年11月17日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年11月8日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version |
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改定 1.3 | 2018年1月24日 | Group: Structure summary / カテゴリ: audit_author / Item: _audit_author.name |
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改定 1.4 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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