登録情報 | データベース: PDB / ID: 3n7b |
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タイトル | SgrAI bound to secondary site DNA and Ca(II) |
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要素 | - DNA (5'-D(*AP*GP*TP*CP*CP*AP*CP*CP*GP*GP*GP*GP*GP*AP*CP*T)-3')
- DNA (5'-D(*AP*GP*TP*CP*CP*CP*CP*CP*GP*GP*TP*GP*GP*AP*CP*T)-3')
- SgraIR restriction enzyme
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キーワード | HYDROLASE/DNA / restriction endonuclease / HYDROLASE-DNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
identical protein binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Restriction Endonuclease - #10 / Restriction endonuclease, type II, Cfr10I/Bse634I / Cfr10I/Bse634I restriction endonuclease / Restriction Endonuclease / Restriction endonuclease type II-like / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / SgraIR restriction enzyme類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Streptomyces griseus (ストレプトマイシン生産菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.65 Å |
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データ登録者 | Horton, N.C. / Little, E.J. / Dunten, P.W. |
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引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 2011 タイトル: New clues in the allosteric activation of DNA cleavage by SgrAI: structures of SgrAI bound to cleaved primary-site DNA and uncleaved secondary-site DNA. 著者: Little, E.J. / Dunten, P.W. / Bitinaite, J. / Horton, N.C. |
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履歴 | 登録 | 2010年5月26日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年11月24日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2019年7月17日 | Group: Data collection / Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version |
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改定 1.3 | 2024年2月21日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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