登録情報 | データベース: PDB / ID: 3n0i |
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タイトル | Crystal Structure of Ad37 fiber knob in complex with GD1a oligosaccharide |
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要素 | Fiber |
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キーワード | CELL ADHESION / adenovirus / fiber knob / ganglioside / GD1a / virus-receptor complex / oligosaccharide structure / protein carbohydrate interaction |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
adhesion receptor-mediated virion attachment to host cell / viral capsid / cell adhesion / symbiont entry into host cell / host cell nucleus / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Adenovirus pIV-related, attachment domain / Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain) / Adenoviral fibre protein, knob / Adenoviral fibre protein (knob domain) / Adenoviral fibre protein, repeat/shaft region / Adenoviral fibre protein (repeat/shaft region) / Adenovirus fibre protein / Attachment protein shaft domain superfamily / Adenovirus pIV-like, attachment domain / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Human adenovirus 37 (ヒトアデノウイルス) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.65 Å |
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データ登録者 | Nilsson, E.C. / Storm, R.J. / Bauer, J. / Johansson, S.M.C. / Lookene, A. / Angstroem, J. / Hedenstroem, M. / Fraengsmyr, L. / Rinaldi, S. / Willison, H. ...Nilsson, E.C. / Storm, R.J. / Bauer, J. / Johansson, S.M.C. / Lookene, A. / Angstroem, J. / Hedenstroem, M. / Fraengsmyr, L. / Rinaldi, S. / Willison, H. / Domelloef, F.P. / Stehle, T. / Arnberg, N. |
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引用 | ジャーナル: NAT.MED. (N.Y.) / 年: 2011 タイトル: The GD1a glycan is a cellular receptor for adenoviruses causing epidemic keratoconjunctivitis. 著者: Nilsson, E.C. / Storm, R.J. / Bauer, J. / Johansson, S.M. / Lookene, A. / Angstrom, J. / Hedenstrom, M. / Eriksson, T.L. / Frangsmyr, L. / Rinaldi, S. / Willison, H.J. / Domellof, F.P. / Stehle, T. / Arnberg, N. |
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履歴 | 登録 | 2010年5月14日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年12月29日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2014年2月19日 | Group: Database references |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / struct_asym / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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