- PDB-3mx7: Crystal Structure Analysis of Human FAIM-NTD -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3mx7
タイトル
Crystal Structure Analysis of Human FAIM-NTD
要素
Fas apoptotic inhibitory molecule 1
キーワード
APOPTOSIS / Beta Sheet
機能・相同性
機能・相同性情報
positive regulation of neurogenesis / canonical NF-kappaB signal transduction / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors / apoptotic process / cytoplasm 類似検索 - 分子機能
解像度: 1.76→1.82 Å / 冗長度: 5 % / Rmerge(I) obs: 0.187 / Mean I/σ(I) obs: 11.041 / Num. unique all: 2521 / Rsym value: 0.187 / % possible all: 99.4
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
HKL-2000
データ収集
SOLVE
位相決定
REFMAC
5.5.0109
精密化
HKL-2000
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.76→28.57 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.957 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.944 / SU B: 1.687 / SU ML: 0.055 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0.16 / ESU R Free: 0.091 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.20045
663
4.9 %
RANDOM
Rwork
0.17645
-
-
-
all
0.179
-
-
-
obs
0.17759
12781
99.27 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK