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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3msv | ||||||
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タイトル | The hypoxic regulator of sterol synthesis Nro1 is a nuclear import adaptor | ||||||
![]() | Nuclear import adaptor, Nro1 | ||||||
![]() | PROTEIN BINDING / helix repeats / HEAT repeats | ||||||
機能・相同性 | ![]() positive regulation of SREBP signaling pathway / cation binding / SREBP signaling pathway / regulation of translation / cellular response to hypoxia / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleus / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Yeh, T.L. / Amzel, L.M. / Bianchet, M.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The hypoxic regulator of sterol synthesis nro1 is a nuclear import adaptor. 著者: Yeh, T.L. / Lee, C.Y. / Amzel, L.M. / Espenshade, P.J. / Bianchet, M.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 156 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 123.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 437.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 461 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 31.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 45.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 44486.340 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: SPCC4B3.07 / プラスミド: pPROEX HTb / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.85 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.87 % |
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 1.3 M ammonium tartrate dibasic, 0.1 M Bis-TrisHCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.5 |
-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 |
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放射波長 |
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反射 | 解像度: 2.18→19.73 Å / Num. all: 51980 / Num. obs: 51200 / % possible obs: 98.5 % / Observed criterion σ(F): -3 / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3.6 % / Rsym value: 0.087 / Net I/σ(I): 12.9 | ||||||||||||||||||
反射 シェル | 解像度: 2.18→2.3 Å / Rmerge(I) obs: 0.515 / % possible all: 93.2 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 32.783 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.18→19.73 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.181→2.237 Å / Total num. of bins used: 20
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