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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3mds | ||||||
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タイトル | MAGANESE SUPEROXIDE DISMUTASE FROM THERMUS THERMOPHILUS | ||||||
![]() | MANGANESE SUPEROXIDE DISMUTASE | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE(SUPEROXIDE ACCEPTOR) / OXIDOREDUCTASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Ludwig, M.L. / Metzger, A.L. / Pattridge, K.A. / Stallings, W.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Manganese superoxide dismutase from Thermus thermophilus. A structural model refined at 1.8 A resolution. 著者: Ludwig, M.L. / Metzger, A.L. / Pattridge, K.A. / Stallings, W.C. #1: ![]() 年: 1992 タイトル: Iron and Manganese Superoxide Dismutases: Catalytic Inferences from the Structures Molecular Biology of Free Radical Scavenging Systems 著者: Stallings, W.C. / Bull, C. / Fee, J.A. / Lah, M.S. / Ludwig, M.L. #2: ![]() タイトル: Structure-Function Relationships in Fe-and Mn-Superoxide Dismutases 著者: Stallings, W.C. / Metzger, A.L. / Pattridge, K.A. / Fee, J.A. / Ludwig, M.L. #3: ![]() タイトル: The Structure of Manganese Superoxide Dismutase from Thermus Thermophilus at 2.4 Angstroms Resolution 著者: Stallings, W.C. / Pattridge, K.A. / Strong, R.K. / Ludwig, M.L. #4: ![]() タイトル: Manganese and Iron Superoxide Dismutases are Structural Homologs 著者: Stallings, W.C. / Pattridge, K.A. / Strong, R.K. / Ludwig, M.L. | ||||||
履歴 |
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Remark 650 | HELIX ASSIGNMENTS OF SECONDARY STRUCTURE ARE BASED ON THE ALGORITHM OF KABSCH AND SANDER, WITH THE ...HELIX ASSIGNMENTS OF SECONDARY STRUCTURE ARE BASED ON THE ALGORITHM OF KABSCH AND SANDER, WITH THE FOLLOWING EXCEPTIONS: HELICES START WITH THE FIRST RESIDUE HAVING A HELICAL HYDROGEN BOND; SUCCESSIVE 3-10 TURNS ARE GIVEN PRIORITY OVER SHORT 3-10 HELICES. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 95.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 74.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 3 / 2: CIS PROLINE - PRO A 18 / 3: CIS PROLINE - PRO B 3 / 4: CIS PROLINE - PRO B 18 | ||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.0591, -0.9384, 0.3403), ベクター: 詳細 | THE TRANSFORMATION PRESENTED ON *MTRIX* RECORDS BELOW WILL YIELD APPROXIMATE COORDINATES FOR CHAIN *B* WHEN APPLIED TO CHAIN *A*. | |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 23129.295 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P61503, superoxide dismutase #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | 配列の詳細 | THE SEQUENCE ASSIGNS LYS RATHER THAN ILE AT POSITION 69; THE FIT OF THIS RESIDUE WILL BE REINVESTIG | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.23 Å3/Da / 溶媒含有率: 61.89 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.8→20 Å / σ(F): 0 詳細: THE SIDE CHAIN OF GLU 101 IS ILL-DEFINED IN THE B CHAIN.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→20 Å
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拘束条件 |
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