登録情報 | データベース: PDB / ID: 3lrt |
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タイトル | Crystal structure of the phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP) synthetase from Thermoplasma volcanium in complex with ADP. |
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要素 | Ribose-phosphate pyrophosphokinase |
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キーワード | TRANSFERASE / Phosphoribosyl transferase / ATP analog binding / ATP-binding / Kinase / Metal-binding / Nucleotide biosynthesis / Nucleotide-binding |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
ribose phosphate diphosphokinase complex / ribose-phosphate diphosphokinase / ribose phosphate diphosphokinase activity / ribonucleoside monophosphate biosynthetic process / 5-phosphoribose 1-diphosphate biosynthetic process / purine nucleotide biosynthetic process / kinase activity / phosphorylation / magnesium ion binding / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Ribose-phosphate pyrophosphokinase, archaea / N-terminal domain of ribose phosphate pyrophosphokinase / Ribose-phosphate pyrophosphokinase / Ribose-phosphate pyrophosphokinase, N-terminal domain / N-terminal domain of ribose phosphate pyrophosphokinase / Rossmann fold - #2020 / Phosphoribosyl transferase domain / Phosphoribosyltransferase-like / Phosphoribosyltransferase domain / Rossmann fold ...Ribose-phosphate pyrophosphokinase, archaea / N-terminal domain of ribose phosphate pyrophosphokinase / Ribose-phosphate pyrophosphokinase / Ribose-phosphate pyrophosphokinase, N-terminal domain / N-terminal domain of ribose phosphate pyrophosphokinase / Rossmann fold - #2020 / Phosphoribosyl transferase domain / Phosphoribosyltransferase-like / Phosphoribosyltransferase domain / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / Ribose-phosphate pyrophosphokinase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Thermoplasma volcanium (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.534 Å |
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データ登録者 | Cherney, M.M. / Cherney, L.T. / Garen, C.R. / James, M.N.G. |
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引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2011 タイトル: The structures of Thermoplasma volcanium phosphoribosyl pyrophosphate synthetase bound to ribose-5-phosphate and ATP analogs. 著者: Cherney, M.M. / Cherney, L.T. / Garen, C.R. / James, M.N. |
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履歴 | 登録 | 2010年2月11日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2011年2月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2012年4月25日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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