PDB-3khu: Crystal structure of human UDP-glucose dehydrogenase Glu161Gln, i...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3khu

タイトル

Crystal structure of human UDP-glucose dehydrogenase Glu161Gln, in complex with thiohemiacetal intermediate

要素

UDP-glucose 6-dehydrogenase

キーワード

OXIDOREDUCTASE / thiohemiacetal intermediate / Structural Genomics / Structural Genomics Consortium / SGC

機能・相同性

機能・相同性情報

Formation of the active cofactor, UDP-glucuronate / chondroitin sulfate biosynthetic process / UDP-glucose 6-dehydrogenase / UDP-glucose 6-dehydrogenase activity / UDP-glucuronate biosynthetic process / heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process / glycosaminoglycan biosynthetic process / gastrulation with mouth forming second / protein hexamerization / neuron development ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.3 Å

データ登録者

Chaikuad, A. / Egger, S. / Yue, W.W. / Guo, K. / Sethi, R. / Filippakopoulos, P. / Muniz, J.R.C. / von Delft, F. / Bountra, C. / Arrowsmith, C.H. ...

引用

ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2012
タイトル: Structural and Kinetic Evidence That Catalytic Reaction of Human UDP-glucose 6-Dehydrogenase Involves Covalent Thiohemiacetal and Thioester Enzyme Intermediates.
著者: Egger, S. / Chaikuad, A. / Klimacek, M. / Kavanagh, K.L. / Oppermann, U. / Nidetzky, B.

履歴

登録	2009年10月30日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2009年11月17日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2011年12月7日	Group: Database references
改定 1.3	2012年1月11日	Group: Database references
改定 1.4	2012年2月1日	Group: Database references
改定 1.5	2021年10月13日	Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / struct_conn ...database_2 / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.6	2023年9月6日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3khu.cif.gz	586.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3khu.ent.gz	480.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3khu.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3khu_validation.pdf.gz	4 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3khu_full_validation.pdf.gz	4 MB	表示
XML形式データ	3khu_validation.xml.gz	112.2 KB	表示
CIF形式データ	3khu_validation.cif.gz	157.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kh/3khu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kh/3khu	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	2q3eS 2qg4 3itk S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	2qg4-4 6c4j-2 3itk-d 5w4x-1 5tjh-d 2qg4-5 6c4j-1 2qg4-1 2qg4-6 6c4k-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#254 - 2021年2月セルロース合成酵素 (Cellulose Synthase) 類似性 (1) #111 - 2009年3月ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase) 類似性 (1) #228 - 2018年12月酵素の指向性進化 (Directed Evolution of Enzymes) 類似性 (1) #127 - 2010年7月クリスタリン (Crystallins) 類似性 (1)

登録構造単位

A: UDP-glucose 6-dehydrogenase

B: UDP-glucose 6-dehydrogenase

C: UDP-glucose 6-dehydrogenase

D: UDP-glucose 6-dehydrogenase

E: UDP-glucose 6-dehydrogenase

F: UDP-glucose 6-dehydrogenase

ヘテロ分子

321 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	203.540, 207.340, 93.400
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	18
Space group name H-M	P2₁2₁2

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D
5	1	E
6	1	F

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Refine code	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	2	A	0 - 129
2	1	1	2	B	0 - 129
3	1	1	2	C	0 - 129
4	1	1	2	D	0 - 129
5	1	1	2	E	0 - 129
6	1	1	2	F	0 - 129
1	2	1	2	A	131 - 160
2	2	1	2	B	131 - 160
3	2	1	2	C	131 - 160
4	2	1	2	D	131 - 160
5	2	1	2	E	131 - 160
6	2	1	2	F	131 - 160
1	3	1	2	A	162 - 466
2	3	1	2	B	162 - 466
3	3	1	2	C	162 - 466
4	3	1	2	D	162 - 466
5	3	1	2	E	162 - 466
6	3	1	2	F	162 - 466

詳細

The hexamer in the asymmetric unit represents the hexameric biological unit.

#1: タンパク質	UDP-glucose 6-dehydrogenase / UDP-Glc dehydrogenase / UDP-GlcDH / UDPGDH 分子量: 52082.434 Da / 分子数: 6 / 断片: UNP residues 1-466 / 変異: E161Q / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: UGDH / プラスミド: pBEN1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)-R3-pRARE2 / 参照: UniProt: O60701, UDP-glucose 6-dehydrogenase
#2: 化合物	ChemComp-UPG / URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-GLUCOSE / URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE GLUCOPYRANOSYL-MONOPHOSPHATE ESTER / UDP-グルコ-ス分子量: 566.302 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₅H₂₄N₂O₁₇P₂
#3: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 17 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#4: 化合物	ChemComp-EPE / 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID / HEPES / HEPES 分子量: 238.305 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₈N₂O₄S / コメント: pH緩衝剤*YM
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1314 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.15 Å³/Da / 溶媒含有率: 60.99 %
結晶化	温度: 277.15 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 18% PEG smears (PEG 400, 600, 1000, 2000, 3350, 4000, 5000 MME, 6000, 8000, 10000), 0.1M HEPES pH 7.5, 5% Ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Diamond / ビームライン: I03 / 波長: 0.9763 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2009年7月15日 / 詳細: mirrors
放射	モノクロメーター: Si(111) double crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9763 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.3→48.74 Å / Num. all: 175207 / Num. obs: 175139 / % possible obs: 99.8 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 4.3 % / R_merge(I) obs: 0.106 / Net I/σ(I): 9.4
反射シェル	解像度: 2.3→2.42 Å / 冗長度: 4.3 % / R_merge(I) obs: 0.743 / Mean I/σ(I) obs: 2 / Num. unique all: 25412 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
ADSC	Quantum	データ収集
PHASER		位相決定
REFMAC	5.5.0089	精密化
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB entry 2Q3E

2q3e

解像度: 2.3→48.74 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.952 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.939 / SU B: 12.897 / SU ML: 0.145 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.248 / ESU R Free: 0.193 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2252	1988	1.1 %	RANDOM
R_work	0.19509	-	-	-
obs	0.19544	173128	99.71 %	-
all	-	175128	-	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 19.743 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-3.2 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	0.75 Å²	0 Å²
3-	-	-	2.45 Å²

Refine analyze

Luzzati coordinate error obs: 0.317 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.3→48.74 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	21667	0	515	1314	23496

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.016	0.022	22822
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.003	0.02	15404
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.438	1.987	31014
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.007	3.002	37383
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.28	5	2844
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	35.178	24.375	1008
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	13.744	15	3895
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	20.67	15	147
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.095	0.2	3586
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.006	0.021	25029
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.003	0.02	4440
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.593	3	13969
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.326	3	5667
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	2.975	5	22638
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	5.293	8	8853
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	7.651	11	8344

Refine LS restraints NCS

Dom-ID: 1 / Ens-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
A	2681	tight positional	0.05	0.05
B	2681	tight positional	0.04	0.05
C	2681	tight positional	0.04	0.05
D	2681	tight positional	0.05	0.05
E	2681	tight positional	0.07	0.05
F	2681	tight positional	0.05	0.05
A	3131	medium positional	0.07	0.5
B	3131	medium positional	0.04	0.5
C	3131	medium positional	0.04	0.5
D	3131	medium positional	0.06	0.5
E	3131	medium positional	0.06	0.5
F	3131	medium positional	0.06	0.5
A	2681	tight thermal	0.19	0.5
B	2681	tight thermal	0.16	0.5
C	2681	tight thermal	0.17	0.5
D	2681	tight thermal	0.17	0.5
E	2681	tight thermal	0.18	0.5
F	2681	tight thermal	0.15	0.5
A	3131	medium thermal	0.15	2
B	3131	medium thermal	0.13	2
C	3131	medium thermal	0.13	2
D	3131	medium thermal	0.13	2
E	3131	medium thermal	0.14	2
F	3131	medium thermal	0.12	2

LS精密化シェル

解像度: 2.3→2.36 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.387	148	-
R_work	0.345	12722	-
obs	-	-	99.9 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.6441	0.5586	-0.6306	1.277	0.1723	2.0796	0.1891	-0.8127	0.227	0.1237	-0.2071	-0.11	0.0672	0.0346	0.018	0.0654	-0.0617	-0.0138	0.2092	-0.0228	0.0627	-67.5254	-32.1478	21.5934
2	4.081	-2.1752	-0.5076	1.8459	0.8565	0.6761	-0.0213	0.0484	-0.1511	0.1292	0.01	-0.1091	0.114	0.0513	0.0113	0.0835	-0.0042	-0.0044	0.0321	0.0524	0.2373	-66.8622	-43.7657	6.4487
3	1.0277	-0.0882	-0.2958	0.0333	-0.021	0.2467	0.0491	0.061	0.1724	-0.015	0.0005	-0.0408	-0.0102	0.0038	-0.0496	0.1156	-0.0045	0.0116	0.0792	0.081	0.2049	-52.5153	-32.3787	2.1516
4	2.8381	-0.5484	0.0459	0.461	-0.2015	1.8362	-0.0543	-0.3	0.0823	0.0438	0.1369	0.0266	0.0715	0.0588	-0.0826	0.0966	0.0348	0.0157	0.1203	0.0409	0.0935	-28.625	-41.4612	20.823
5	2.4307	-0.7572	-0.0689	1.2403	0.4948	1.6697	-0.206	-0.5852	-0.2007	0.2932	0.024	0.1694	0.4201	0.002	0.182	0.2111	0.0502	0.0806	0.2733	0.1383	0.1384	-1.2901	-66.4373	22.4555
6	1.6383	-1.0149	-0.3036	1.0693	0.5764	1.0396	-0.0427	-0.2146	-0.0332	0.0362	-0.0221	0.1048	0.0894	0.0525	0.0648	0.0833	0.0086	-0.0137	0.1859	0.0419	0.0859	3.8449	-57.4811	12.6962
7	0.6418	0.2202	0.0826	0.4465	-0.1591	0.6013	0.013	0.0705	-0.0911	-0.0149	0.0116	0.0381	0.1167	0.0158	-0.0246	0.1541	0.021	-0.0249	0.1541	0.0043	0.1381	-11.1109	-69.8543	-6.8018
8	2.1097	1.246	0.5789	2.0023	0.1841	1.315	0.161	-0.094	-0.3578	0.0904	-0.0315	-0.0319	0.1958	-0.0035	-0.1295	0.1688	0.0049	-0.0453	0.0726	0.0779	0.2868	-21.3009	-91.0856	0.4305
9	3.0372	0.2526	-0.0078	1.5101	0.5802	2.2143	-0.0138	0.2881	0.0281	-0.0836	0.1077	-0.2156	0.0334	0.0665	-0.0939	0.1476	0.0598	0.0428	0.2974	-0.07	0.1804	7.5833	-76.1436	-43.0348
10	1.666	-1.1831	-1.5752	1.39	0.926	1.5686	-0.0393	0.3245	-0.1955	0.009	-0.1234	0.1158	0.0768	-0.2978	0.1628	0.2006	0.0343	-0.0425	0.3981	-0.1149	0.1956	-11.4892	-77.5307	-39.4224
11	0.4501	0.0525	-0.0048	0.1405	0.1415	0.6594	0.0118	0.1707	-0.2175	-0.0471	-0.0053	-0.0311	0.1232	0.0102	-0.0065	0.1741	0.0275	-0.0114	0.2313	-0.0368	0.1914	-4.2403	-73.3629	-22.3418
12	1.3854	-0.4245	-0.5876	2.6103	0.4078	1.2222	0.2109	0.3099	0.4332	-0.2912	0.019	-0.4048	-0.1115	0.0387	-0.23	0.1023	0.0121	0.1004	0.2059	0.1155	0.2474	-0.0442	-42.0804	-22.9285
13	4.0368	0.5523	-1.8127	1.0883	-0.9216	1.392	-0.026	0.0594	-0.4946	0.1554	-0.1118	0.1289	-0.0809	0.1562	0.1378	0.1391	-0.0094	0.0071	0.0909	0.0013	0.3726	-59.2507	-105.1076	-9.7874
14	1.4685	-0.7769	-0.2765	2.7058	-0.0588	0.0777	-0.0511	-0.0388	-0.1392	0.1437	-0.0107	-0.2611	-0.0183	-0.0114	0.0619	0.2034	0.0026	-0.0309	0.0812	0.0138	0.3582	-41.418	-98.9442	-12.516
15	0.6888	-0.4289	-0.0636	1.0915	-0.3402	0.259	-0.0131	0.2468	-0.156	-0.1057	0.0216	0.1013	0.0552	-0.0281	-0.0085	0.2073	-0.0008	-0.0158	0.2105	-0.0331	0.2591	-57.6055	-86.8052	-25.5767
16	1.6372	-0.6366	-0.8527	0.618	0.5544	0.6385	-0.045	0.0467	-0.0185	0.0033	0.0301	-0.0095	0.0912	0.057	0.0149	0.1411	0.0261	-0.0071	0.0891	0.0763	0.155	-65.0034	-69.0589	-5.8764
17	1.5414	-0.4213	-0.3651	1.7127	0.0126	2.4681	0.1451	0.4703	0.8228	-0.4317	0.0295	-0.251	-0.298	0.0217	-0.1746	0.3015	-0.0274	0.1517	0.1887	0.2948	0.6102	-20.1447	-4.9936	-19.0848
18	0.9353	0.6869	0.1631	3.7438	1.1484	0.5314	0.0721	0.2781	0.1733	-0.2579	0.148	-0.3954	-0.1311	0.0944	-0.2201	0.1481	-0.034	0.1107	0.1698	0.1223	0.4095	-14.0953	-23.6216	-16.009
19	1.1598	0.0386	-0.1237	0.6914	0.1431	0.2969	0.0209	0.0983	0.284	-0.0375	0.0355	-0.1226	-0.0203	0.059	-0.0564	0.1362	-0.004	0.0398	0.0944	0.1235	0.2806	-31.0851	-23.4392	-7.5653
20	1.3484	0.2059	1.0523	1.0153	0.006	1.8338	0.0307	0.3436	0.2355	-0.2028	0.0369	0.0702	-0.0594	0.0619	-0.0676	0.1817	0.018	0.0101	0.2305	0.2185	0.2197	-51.4211	-27.5015	-30.9465
21	2.3836	0.6217	-0.3266	2.6004	-0.5916	2.2673	0.0154	0.5654	-0.0685	-0.4276	-0.1215	0.2074	0.1824	-0.0798	0.1061	0.1627	0.0513	-0.0559	0.6391	0.1271	0.1015	-68.9383	-56.5809	-56.1186
22	3.1811	0.2526	0.9807	0.505	0.357	1.1476	-0.1344	0.2726	0.3163	-0.0015	-0.0018	-0.062	-0.0307	-0.1131	0.1362	0.1378	0.0247	-0.0194	0.3719	0.1669	0.1818	-61.9183	-47.4014	-40.0588
23	0.9108	-0.1952	0.1342	0.6522	-0.1726	0.3816	0.0457	0.3274	0.0366	-0.0379	-0.0448	0.0645	0.0793	-0.1098	-0.0009	0.1939	0.0025	-0.0108	0.3184	0.0593	0.1605	-60.9974	-65.5475	-35.0056
24	2.6606	-0.2745	-0.2886	1.1309	0.5147	2.1717	0.0233	0.5088	-0.1193	-0.061	0.1453	0.0036	0.0277	0.2653	-0.1686	0.1575	-0.0033	-0.0051	0.5118	-0.0643	0.1047	-34.1769	-75.9889	-47.9955

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	0 - 80
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	81 - 142
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	143 - 310
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	311 - 466
5	X-RAY DIFFRACTION	5	C	0 - 119
6	X-RAY DIFFRACTION	6	C	120 - 214
7	X-RAY DIFFRACTION	7	C	215 - 311
8	X-RAY DIFFRACTION	8	C	312 - 466
9	X-RAY DIFFRACTION	9	D	0 - 90
10	X-RAY DIFFRACTION	10	D	91 - 142
11	X-RAY DIFFRACTION	11	D	143 - 310
12	X-RAY DIFFRACTION	12	D	311 - 466
13	X-RAY DIFFRACTION	13	E	1 - 91
14	X-RAY DIFFRACTION	14	E	92 - 161
15	X-RAY DIFFRACTION	15	E	162 - 266
16	X-RAY DIFFRACTION	16	E	267 - 466
17	X-RAY DIFFRACTION	17	B	0 - 89
18	X-RAY DIFFRACTION	18	B	90 - 142
19	X-RAY DIFFRACTION	19	B	143 - 310
20	X-RAY DIFFRACTION	20	B	311 - 466
21	X-RAY DIFFRACTION	21	F	0 - 88
22	X-RAY DIFFRACTION	22	F	89 - 142
23	X-RAY DIFFRACTION	23	F	143 - 310
24	X-RAY DIFFRACTION	24	F	311 - 466

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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