登録情報 | データベース: PDB / ID: 3iwd |
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タイトル | T. maritima AdoMetDC complex with 5'-Deoxy-5'-dimethyl thioadenosine |
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要素 | (S-adenosylmethionine decarboxylase) x 2 |
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キーワード | LYASE / Autocatalytic cleavage / Decarboxylase / Polyamine biosynthesis / Pyruvate / S-adenosyl-L-methionine / Schiff base / Spermidine biosynthesis / Zymogen |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
adenosylmethionine decarboxylase / adenosylmethionine decarboxylase activity / spermidine biosynthetic process / cytosol類似検索 - 分子機能 Double Stranded RNA Binding Domain - #750 / S-adenosylmethionine decarboxylase domain / S-adenosylmethionine decarboxylase, N-terminal / S-adenosylmethionine decarboxylase, C-terminal / S-adenosylmethionine decarboxylase family, prokaryotic / S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme / S-adenosylmethionine decarboxylase / S-adenosylmethionine decarboxylase, core / Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 / Double Stranded RNA Binding Domain ...Double Stranded RNA Binding Domain - #750 / S-adenosylmethionine decarboxylase domain / S-adenosylmethionine decarboxylase, N-terminal / S-adenosylmethionine decarboxylase, C-terminal / S-adenosylmethionine decarboxylase family, prokaryotic / S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme / S-adenosylmethionine decarboxylase / S-adenosylmethionine decarboxylase, core / Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 / Double Stranded RNA Binding Domain / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-M2T / S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Thermotoga maritima (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.9 Å |
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データ登録者 | Bale, S. / Kavita, B. / Ealick, S.E. |
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引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 2010 タイトル: Complexes of Thermotoga maritimaS-adenosylmethionine decarboxylase provide insights into substrate specificity. 著者: Bale, S. / Baba, K. / McCloskey, D.E. / Pegg, A.E. / Ealick, S.E. |
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履歴 | 登録 | 2009年9月2日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年2月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年11月1日 | Group: Advisory / Refinement description / カテゴリ: pdbx_validate_polymer_linkage / software |
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改定 1.3 | 2023年9月6日 | Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_validate_polymer_linkage / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 2.0 | 2023年11月15日 | Group: Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom ...atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / struct_conn Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id |
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