登録情報 | データベース: PDB / ID: 3g52 |
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タイトル | Ligand migration and cavities within scapharca dimeric hemoglobin: wild type with co bound to heme and chloroethyl benzene bound to the XE4 cavity |
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要素 | GLOBIN-1 |
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キーワード | OXYGEN BINDING / OXYGEN TRANSPORT / ALLOSTERY / OXYGEN AFFINITY / CYTOPLASM / HEME / IRON / METAL-BINDING / OXYGEN STORAGE/TRANSPORT |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
oxygen carrier activity / oxygen binding / response to hypoxia / heme binding / identical protein binding / metal ion binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 : / Myoglobin-like, M family globin domain / Globin/Protoglobin / Globins / Globin domain profile. / Globin-like / Globin / Globin / Globin-like superfamily / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 (2-chloroethyl)benzene / CARBON MONOXIDE / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / Globin-1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Scapharca inaequivalvis (無脊椎動物) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.65 Å |
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データ登録者 | Knapp, J.E. / Pahl, R. / Cohen, J. / Nichols, J.C. / Schulten, K. / Gibson, Q.H. / Srajer, V. / Royer Jr., W.E. |
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引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2009 タイトル: Ligand migration and cavities within Scapharca Dimeric HbI: studies by time-resolved crystallo-graphy, Xe binding, and computational analysis. 著者: Knapp, J.E. / Pahl, R. / Cohen, J. / Nichols, J.C. / Schulten, K. / Gibson, Q.H. / Srajer, V. / Royer, W.E. |
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履歴 | 登録 | 2009年2月4日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2009年12月1日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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