PDB-3el9: Crystal structure of atazanavir (ATV) in complex with a multidrug...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3el9

タイトル

Crystal structure of atazanavir (ATV) in complex with a multidrug HIV-1 protease (V82T/I84V)

要素

Protease

キーワード

HYDROLASE / drug resistance / entropy enthalpy compensation / hiv protease / atazanavir / AIDS

機能・相同性

機能・相同性情報

HIV-1 retropepsin / symbiont-mediated activation of host apoptosis / retroviral ribonuclease H / exoribonuclease H / exoribonuclease H activity / host multivesicular body / DNA integration / viral genome integration into host DNA / RNA-directed DNA polymerase / establishment of integrated proviral latency ...
類似検索 - 分子機能

Reverse transcriptase connection / Reverse transcriptase connection domain / Reverse transcriptase thumb / Reverse transcriptase thumb domain / Integrase Zinc binding domain / Zinc finger integrase-type profile. / Integrase-like, N-terminal / Integrase DNA binding domain / Integrase, C-terminal domain superfamily, retroviral / Integrase, N-terminal zinc-binding domain ...
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

HIV-1 M:B_ARV2/SF2 (ヒト免疫不全ウイルス)

手法

X線回折 / 解像度: 1.6 Å

データ登録者

Prabu-Jeyabalan, M. / King, N. / Schiffer, C.

引用

ジャーナル: Acs Chem.Biol. / 年: 2012
タイトル: Extreme Entropy-Enthalpy Compensation in a Drug-Resistant Variant of HIV-1 Protease.
著者: King, N.M. / Prabu-Jeyabalan, M. / Bandaranayake, R.M. / Nalam, M.N. / Nalivaika, E.A. / Ozen, A. / Yilmaz, N.K. / Schiffer, C.A.

履歴

登録	2008年9月21日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2009年9月1日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Refinement description / Version format compliance
改定 1.2	2012年7月25日	Group: Database references
改定 1.3	2012年10月17日	Group: Database references
改定 1.4	2017年10月25日	Group: Refinement description / カテゴリ: software
改定 1.5	2021年10月20日	Group: Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / database_2 ...chem_comp / database_2 / entity / pdbx_entity_nonpoly / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms ..._chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.6	2023年8月30日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
改定 1.7	2024年3月13日	Group: Source and taxonomy / Structure summary / カテゴリ: entity / pdbx_entity_src_syn / Item: _entity.details

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3el9.cif.gz	56.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3el9.ent.gz	42.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3el9.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/el/3el9 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/el/3el9	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3ekpC 3ekqC 3ektC 3ekvC 3ekwC 3ekxC 3ekyC 3el0C 3el1C 3el4C 3el5C 1f7aS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1tsq-d 5kr2-2 1zpk-d 1d4j-d 4cpt-d 3gga-1 4rvx-1 3qrm-d 2o4s-d 6dj5-d 6dh3-d 1hps-d 6b3g-d 1pro-d 3b7v-d 2cen-d 1w5w-d 2uxz-d 6c8y-d 2pqz-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#6 - 2000年6月 HIV-1タンパク質分解酵素 (HIV-1 Protease) 類似性 (1) #163 - 2013年7月 HIVカプシド (HIV Capsid) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Protease

B: Protease

ヘテロ分子

22.9 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	50.729, 58.065, 61.396
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Protease / Retropepsin / PR 分子量: 10789.709 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP residues 484-582 / 変異: Q7K, V82T, I84V / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) HIV-1 M:B_ARV2/SF2 (ヒト免疫不全ウイルス) 株: HXB2 / 遺伝子: gag-pol / プラスミド: pEN / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): TAP106 / 参照: UniProt: P03369, HIV-1 retropepsin
#2: 化合物	ChemComp-DR7 / (3S,8S,9S,12S)-3,12-BIS(1,1-DIMETHYLETHYL)-8-HYDROXY-4,11-DIOXO-9-(PHENYLMETHYL)-6-[[4-(2-PYRIDINYL)PHENYL]METHYL]-2,5, 6,10,13-PENTAAZATETRADECANEDIOIC ACID DIMETHYL ESTER / ATAZANAVIR / METHYL [(1S,4S,5S,10S)-4-BENZYL-1,10-DI-TERT-BUTYL-5-HYDROXY-2,9,12-TRIOXO-7-(4-PYRIDIN-2-YLBENZYL)-13-OXA-3,7,8,11-TETRAAZATET RADEC-1-YL]CARBAMATE / アタザナビル分子量: 704.855 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₈H₅₂N₆O₇ / 詳細: DR7 synthesized chemically / コメント: 薬剤, 抗レトロウイルス剤*YM
#3: 化合物	ChemComp-ACT / ACETATE ION / 酢酸イオン分子量: 59.044 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₃O₂
#4: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト分子量: 94.971 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 133 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.11 Å³/Da / 溶媒含有率: 41.76 %
結晶化	温度: 300 K / pH: 6.2 詳細: pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 140 K
放射光源	由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU / 波長: 1.5418
検出器	タイプ: RIGAKU RAXIS IV / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2006年2月7日 / 詳細: YALE MIRRORS
放射	モノクロメーター: YALE MIRRORS / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.6→40 Å / Num. obs: 23108 / % possible obs: 93.6 % / 冗長度: 3.8 % / R_merge(I) obs: 0.063 / Net I/σ(I): 19.415
反射シェル	解像度: 1.6→1.66 Å / 冗長度: 2.8 % / R_merge(I) obs: 0.706 / % possible all: 90.3

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
REFMAC	5.2.0005	精密化
PDB_EXTRACT	3.006	データ抽出
AMoRE		位相決定

精密化

開始モデル: 1F7A

1f7a

解像度: 1.6→40 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.962 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.957 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / SU B: 3.896 / SU ML: 0.075 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.107 / ESU R Free: 0.1 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.217	1162	5 %	RANDOM
R_work	0.192	-	-	-
obs	0.194	23072	93.6 %	-
all	-	23072	-	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 26.86 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.31 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-0.22 Å²	0 Å²
3-	-	-	0.53 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.6→40 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	1474	0	85	133	1692

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.006	0.022	1582
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	1500
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.349	2.034	2163
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.706	3	3475
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.234	5	196
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	40.878	25.385	52
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	10.19	15	246
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	8.633	15	6
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.076	0.2	254
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.02	1706
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	277
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.192	0.2	221
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.177	0.2	1505
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.172	0.2	741
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.08	0.2	1000
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.129	0.2	89
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.202	0.2	11
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.206	0.2	63
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.185	0.2	17
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.649	1.5	1258
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.146	1.5	412
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.798	2	1585
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.462	3	673
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	2.141	4.5	578
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 1.6→1.64 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.427	61	-
R_work	0.324	1549	-
obs	-	-	89.3 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.5213	-1.2282	-1.5998	2.0527	0.1572	2.8951	-0.0947	-0.0971	0.049	0.2188	0.0547	0.0379	0.1305	0.0098	0.04	-0.0443	0.0211	0.0141	-0.0484	0.003	-0.0864	20.82	20.49	28.692
2	14.2868	-4.5331	3.1962	5.5177	-3.7035	2.6549	0.0825	0.2599	-0.6214	-0.0812	-0.1353	0.3474	0.2683	0.1405	0.0528	-0.0465	-0.005	-0.0086	-0.0616	-0.0367	-0.0672	19.089	16.283	16.17
3	9.5894	3.9586	-3.0939	2.708	-1.549	7.0676	-0.1422	-0.4277	0.4645	0.3944	0.3172	-0.018	-0.258	0.1551	-0.175	0.0022	0.0274	0.0017	-0.0309	-0.0437	-0.0616	21.656	33.479	27.998
4	3.5751	1.2543	0.4573	2.9226	0.0191	1.8872	0.0471	-0.1001	-0.0601	-0.182	0.0257	-0.09	-0.0568	0.0317	-0.0729	-0.0712	0.0097	-0.0087	-0.0489	0.011	-0.0674	14.566	28.205	19.464
5	8.9314	-2.2885	0.3369	10.2461	4.8313	5.1448	0.2515	0.3475	-0.1422	0.1638	-0.3937	0.4413	0.218	-0.5941	0.1421	-0.0956	-0.007	0.0065	0.0361	0.0694	-0.1069	-0.157	34.673	13.853
6	4.5508	1.1834	-0.4622	3.4401	0.724	1.7958	-0.0431	0.0932	-0.0067	-0.0272	-0.003	-0.0523	-0.1371	-0.1157	0.0461	-0.0661	0.0167	-0.0157	-0.0722	0.0161	-0.0752	26.114	26.804	17.904
7	5.2736	2.7892	1.1564	3.7671	4.6571	7.849	0.0637	0.2998	0.1565	-0.075	0.1671	-0.2653	-0.2301	0.7212	-0.2308	-0.0869	0.0091	0.0085	0.0156	0.0609	-0.0331	39.419	30.952	10.01
8	14.6492	-1.1042	-1.1988	5.3622	-3.4126	2.4226	-0.1756	0.078	-0.1437	0.0722	0.1473	0.182	0.1642	0.0396	0.0283	-0.0663	0.0055	0.0066	-0.0613	0.0069	-0.081	12.542	40.016	11.798
9	11.8421	-2.1708	-1.0599	4.6669	-1.594	3.7617	-0.1628	0.148	-0.1656	-0.0098	0.1276	0.0214	0.0362	0.0745	0.0353	-0.086	0.0036	0.008	-0.058	-0.0099	-0.131	27.196	30.189	3.619
10	4.3884	3.5524	-6.7262	5.0198	-6.5266	10.9071	0.0775	0.0024	0.3396	0.1976	0.329	0.3617	-0.2259	-0.316	-0.4065	-0.0823	0.0359	0.0132	-0.0118	0.0444	-0.0194	1.716	36.554	18.783
11	44.4396	-27.9361	4.5604	38.2905	-4.1116	4.4996	0.7218	1.568	-1.4573	-0.6573	-0.7665	-0.0412	0.0998	0.4494	0.0447	-0.0369	-0.0499	0.0166	0.0607	-0.0943	0.0192	3.881	23.374	24.842
12	2.1439	1.6821	-3.2146	5.3507	-5.9185	7.6815	0.0082	-0.0751	-0.1502	-0.2238	-0.0161	0.2964	0.2305	-0.0108	0.008	-0.0712	0.0065	-0.0177	-0.0632	0.0199	-0.0174	4.598	29.69	24.931
13	4.9752	-5.5365	2.7935	11.7947	-10.6432	18.2862	0.2108	0.2993	-0.0415	-0.0352	-0.4361	-0.3103	0.0588	0.8417	0.2253	-0.1389	-0.0061	0.0316	0.0053	-0.0087	-0.0648	38.655	25.161	8.984
14	15.4241	-0.728	-19.7981	6.6496	6.4398	39.7627	0.271	0.0028	0.9222	0.3973	0.1507	-0.1197	-0.0223	-0.082	-0.4217	-0.0418	0	-0.0398	-0.0552	-0.0139	-0.0074	37.594	24.079	23.71
15	2.3872	-1.9647	0.5532	3.1577	-1.5948	4.6684	0.0417	0.044	0.0842	-0.0633	-0.146	-0.1858	0.0893	0.1735	0.1043	-0.0771	-0.0227	0.0009	-0.0702	-0.0072	-0.0588	36.005	21.8	17.222
16	4.6931	-3.4917	3.9979	5.5204	-3.2493	5.6065	0.3117	0.4164	-0.0228	-0.3845	-0.2096	-0.0401	0.2911	0.3789	-0.1021	-0.0713	0.0151	-0.0149	-0.0324	0.0111	-0.0683	10.264	29.146	12.593
17	0.3921	-0.9655	0.9366	5.2459	-0.7576	3.0729	0.1139	0.0834	0.1209	0.1511	-0.0628	0.3136	-0.3908	-0.006	-0.051	-0.0555	-0.0081	-0.009	-0.0342	0.0212	-0.0205	29.64	32.905	14.17
18	3.0823	-3.0287	-0.2722	6.2271	-4.5959	7.2995	-0.1637	-0.1917	0.0045	0.1188	0.3248	0.2717	0.2111	-0.2954	-0.1611	-0.0334	0.0122	0.0059	-0.0086	0.0056	-0.0471	12.138	28.973	27.046
19	2.2159	-2.4356	2.2399	3.3452	-1.1349	4.9003	-0.0782	-0.1308	-0.1391	0.137	0.1105	-0.0073	-0.1326	-0.0708	-0.0323	-0.07	0.0018	-0.0075	-0.0329	-0.0023	-0.0726	29.058	19.628	19.543
20	6.4387	-0.7454	0.0976	10.9299	4.9717	9.3732	0.0052	-0.0925	0.1061	-0.3689	-0.1715	0.1942	-0.3152	0.1683	0.1662	-0.0359	0.0012	0	-0.0244	0.0294	-0.0617	20.168	31.43	14.103

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1 - 5
2	X-RAY DIFFRACTION	1	A	94 - 99
3	X-RAY DIFFRACTION	1	B	1 - 5
4	X-RAY DIFFRACTION	1	B	94 - 99
5	X-RAY DIFFRACTION	2	A	6 - 10
6	X-RAY DIFFRACTION	3	B	6 - 10
7	X-RAY DIFFRACTION	4	A	22 - 32
8	X-RAY DIFFRACTION	5	A	33 - 43
9	X-RAY DIFFRACTION	6	B	22 - 32
10	X-RAY DIFFRACTION	7	B	33 - 43
11	X-RAY DIFFRACTION	8	A	44 - 49
12	X-RAY DIFFRACTION	8	A	52 - 56
13	X-RAY DIFFRACTION	9	B	44 - 49
14	X-RAY DIFFRACTION	9	B	52 - 56
15	X-RAY DIFFRACTION	10	A	57 - 62
16	X-RAY DIFFRACTION	11	A	63 - 68
17	X-RAY DIFFRACTION	12	A	69 - 76
18	X-RAY DIFFRACTION	13	B	57 - 62
19	X-RAY DIFFRACTION	14	B	63 - 68
20	X-RAY DIFFRACTION	15	B	69 - 76
21	X-RAY DIFFRACTION	16	A	77 - 85
22	X-RAY DIFFRACTION	17	B	77 - 85
23	X-RAY DIFFRACTION	18	A	86 - 93
24	X-RAY DIFFRACTION	19	B	86 - 93
25	X-RAY DIFFRACTION	20	A	100

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)