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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3dwf | ||||||
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タイトル | Crystal Structure of the Guinea Pig 11beta-Hydroxysteroid Dehydrogenase Type 1 Mutant F278E | ||||||
![]() | 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 1 | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / Rossmann Fold / short chain dehydrogenase reductase / SDR / Endoplasmic reticulum / Glycoprotein / Lipid metabolism / Membrane / NADP / Signal-anchor / Steroid metabolism / Transmembrane | ||||||
機能・相同性 | ![]() cortisol dehydrogenase (NADP+) activity / 11beta-hydroxysteroid dehydrogenase / 7beta-hydroxysteroid dehydrogenase (NADP+) / 7-beta-hydroxysteroid dehydrogenase (NADP+) activity / steroid catabolic process / steroid binding / lung development / NADP binding / endoplasmic reticulum membrane / protein homodimerization activity 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Lawson, A.J. / Ride, J.P. / White, S.A. / Walker, E.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Mutations of key hydrophobic surface residues of 11 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 1 increase solubility and monodispersity in a bacterial expression system 著者: Lawson, A.J. / Walker, E.A. / White, S.A. / Dafforn, T.R. / Stewart, P.M. / Ride, J.P. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 446.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 370.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 30361.188 Da / 分子数: 4 / 変異: F278E / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: Q6QLL4, 11beta-hydroxysteroid dehydrogenase #2: 化合物 | ChemComp-NAP / #3: 化合物 | ChemComp-SO4 / #4: 化合物 | ChemComp-GOL / #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.43 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.47 % |
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 8 詳細: 0.1M Tris-HCl, 1.75M ammonium sulphate and 5% glycerol, pH 8, Vapor diffusion, temperature 291K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 2007年7月15日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.933 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.2→34.68 Å / Num. obs: 60967 / Biso Wilson estimate: 34.468 Å2 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→34.68 Å / FOM work R set: 0.834 / 立体化学のターゲット値: ml
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溶媒の処理 | Bsol: 63.469 Å2 / ksol: 0.375 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso max: 180.64 Å2 / Biso mean: 43.75 Å2 / Biso min: 10.48 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→34.68 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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精密化 TLSグループ |
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