登録情報 データベース : PDB / ID : 3d2z 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Complex of the N-acetylmuramyl-L-alanine amidase AmiD from E.coli with the product L-Ala-D-gamma-Glu-L-Lys 要素L-Ala-D-gamma-Glu-L-Lys peptide N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase amiD 詳細キーワード HYDROLASE / ZINC AMIDASE / PGRP / Peptidoglycan Recognizing Protein / AmpD / N-ACETYLMURAMYL-L-ALANINE AMIDASE / Cell wall biogenesis/degradation / Lipoprotein / Membrane / Metal-binding / Outer membrane / Palmitate機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
N-acetyl-anhydromuramoyl-L-alanine amidase activity / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity / peptidoglycan turnover / outer membrane / peptidoglycan catabolic process / cell outer membrane / cell wall organization / zinc ion binding 類似検索 - 分子機能 Muramoyl-pentapeptide Carboxypeptidase; domain 1 / PGBD-like superfamily/PGBD / PGBD superfamily / Lysozyme-like / Peptidoglycan recognition protein-like / Ami_2 / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase/PGRP domain superfamily / PGBD-like superfamily ... Muramoyl-pentapeptide Carboxypeptidase; domain 1 / PGBD-like superfamily/PGBD / PGBD superfamily / Lysozyme-like / Peptidoglycan recognition protein-like / Ami_2 / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase/PGRP domain superfamily / PGBD-like superfamily / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Escherichia coli str. K12 substr. MG1655 (大腸菌)手法 X線回折 / 分子置換 / 解像度 : 2.8 Å 詳細データ登録者 Kerff, F. / Petrella, S. / Herman, R. / Sauvage, E. / Mercier, F. / Luxen, A. / Frere, J.M. / Joris, B. / Charlier, P. 引用ジャーナル : J.Mol.Biol. / 年 : 2010タイトル : Specific Structural Features of the N-Acetylmuramoyl-l-Alanine Amidase AmiD from Escherichia coli and Mechanistic Implications for Enzymes of This Family.著者 : Kerff, F. / Petrella, S. / Mercier, F. / Sauvage, E. / Herman, R. / Pennartz, A. / Zervosen, A. / Luxen, A. / Frere, J.M. / Joris, B. / Charlier, P. 履歴 登録 2008年5月9日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2009年6月16日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月27日 Group : Database references / Derived calculations / Non-polymer description改定 1.3 2023年8月30日 Group : Advisory / Data collection ... Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_validate_polymer_linkage / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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