登録情報 | データベース: PDB / ID: 3bsu |
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タイトル | Hybrid-binding domain of human RNase H1 in complex with 12-mer RNA/DNA |
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要素 | - DNA (5'-D(*DGP*DAP*DAP*DTP*DCP*DAP*DGP*DGP*(5IU)P*DGP*DTP*DC)-3')
- RNA (5'-R(*GP*AP*CP*AP*CP*CP*UP*GP*AP*UP*UP*C)-3')
- Ribonuclease H1
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キーワード | HYDROLASE/RNA/DNA / RNase H / RNA/DNA hybrid / dsRNA / HYDROLASE-RNA-DNA COMPLEX |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
DNA replication, removal of RNA primer / RNA catabolic process / ribonuclease H / RNA nuclease activity / RNA-DNA hybrid ribonuclease activity / nucleic acid binding / magnesium ion binding / RNA binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Ribonuclease H1, N-terminal domain / Ribonuclease H1, eukaryote / Ribonuclease HI; Chain A / Ribonuclease H1, N-terminal / Ribonuclease H1, N-terminal domain superfamily / Caulimovirus viroplasmin / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / RNase H / Ribonuclease H domain / RNase H type-1 domain profile. ...Ribonuclease H1, N-terminal domain / Ribonuclease H1, eukaryote / Ribonuclease HI; Chain A / Ribonuclease H1, N-terminal / Ribonuclease H1, N-terminal domain superfamily / Caulimovirus viroplasmin / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / RNase H / Ribonuclease H domain / RNase H type-1 domain profile. / Ribonuclease H superfamily / Ribonuclease H-like superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / RNA / RNA (> 10) / Ribonuclease H1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å |
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データ登録者 | Nowotny, M. / Cerritelli, S.M. / Ghirlando, R. / Gaidamakov, S.A. / Crouch, R.J. / Yang, W. |
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引用 | ジャーナル: Embo J. / 年: 2008 タイトル: Specific recognition of RNA/DNA hybrid and enhancement of human RNase H1 activity by HBD. 著者: Nowotny, M. / Cerritelli, S.M. / Ghirlando, R. / Gaidamakov, S.A. / Crouch, R.J. / Yang, W. |
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履歴 | 登録 | 2007年12月26日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2008年3月25日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2024年2月21日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_conn / struct_conn_type / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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