登録情報 | データベース: PDB / ID: 3bbh |
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タイトル | M. jannaschii Nep1 complexed with Sinefungin |
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要素 | Ribosome biogenesis protein NEP1-like |
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キーワード | TRANSFERASE / methyltransferase / ribosome biogenesis / S-adenosyl-methionine / sinefungin / rRNA processing |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
rRNA (pseudouridine) methyltransferase activity / rRNA base methylation / 転移酵素; 一炭素原子の基を移すもの; メチル基を移すもの / rRNA binding / protein homodimerization activity類似検索 - 分子機能 Ribosome biogenesis methyltransferase NEP1, archaea / Ribosomal biogenesis, methyltransferase, EMG1/NEP1 / EMG1/NEP1 methyltransferase / SPOUT methyltransferase, trefoil knot domain / Alpha/beta knot / tRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, N-terminal / Alpha/beta knot methyltransferases / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 SINEFUNGIN / Ribosomal RNA small subunit methyltransferase Nep1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Methanocaldococcus jannaschii (メタン生成菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.25 Å |
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データ登録者 | Taylor, A.B. / Meyer, B. / Leal, B.Z. / Kotter, P. / Hart, P.J. / Entian, K.-D. / Wohnert, J. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2008 タイトル: The crystal structure of Nep1 reveals an extended SPOUT-class methyltransferase fold and a pre-organized SAM-binding site. 著者: Taylor, A.B. / Meyer, B. / Leal, B.Z. / Kotter, P. / Schirf, V. / Demeler, B. / Hart, P.J. / Entian, K.D. / Wohnert, J. |
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履歴 | 登録 | 2007年11月9日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2008年2月5日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2023年8月30日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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