登録情報 データベース : PDB / ID : 2zoo 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of nitrite reductase from Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125 要素Probable nitrite reductase 詳細 キーワード OXIDOREDUCTASE / nitrite / electron transfer / Electron transport / Heme / Iron / Metal-binding / Transport機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
denitrification pathway / nitrite reductase (NO-forming) / nitrite reductase (NO-forming) activity / nitrate assimilation / periplasmic space / electron transfer activity / copper ion binding / heme binding 類似検索 - 分子機能 Nitrite reductase, copper-type / Cytochrome c / Multicopper oxidase, type 1 / Multicopper oxidase / Cytochrome c-like domain / Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2 / Multicopper oxidase, N-terminal / Multicopper oxidase / Cupredoxins - blue copper proteins / Cytochrome c family profile. ... Nitrite reductase, copper-type / Cytochrome c / Multicopper oxidase, type 1 / Multicopper oxidase / Cytochrome c-like domain / Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2 / Multicopper oxidase, N-terminal / Multicopper oxidase / Cupredoxins - blue copper proteins / Cytochrome c family profile. / Cytochrome c-like domain / Cytochrome c-like domain superfamily / Cupredoxin / Immunoglobulin-like / Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Beta / Mainly Alpha 類似検索 - ドメイン・相同性 sucrose / COPPER (II) ION / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / Copper-containing nitrite reductase 類似検索 - 構成要素生物種 Pseudoalteromonas haloplanktis (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.95 Å 詳細データ登録者 Nojiri, M. / Tsuda, A. / Yamaguchi, K. / Suzuki, S. 引用ジャーナル : To be Published タイトル : Electron transfer processes within and between proteins containing the HEME C and blue Cu著者 : Nojiri, M. / Koteishi, H. / Tsuda, A. / Nakagami, T. / Kobayashi, K. / Inoue, T. / Yamaguchi, K. / Suzuki, S. 履歴 登録 2008年5月27日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2009年6月9日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Source and taxonomy / Version format compliance改定 2.0 2020年7月29日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / entity_name_com / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_molecule_features / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_conn_angle / struct_asym / struct_conn / struct_conn_type / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.type / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_asym.entity_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年11月1日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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