PDB-2y6e: Structure of the D1D2 domain of USP4, the conserved catalytic domain

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2y6e

タイトル

Structure of the D1D2 domain of USP4, the conserved catalytic domain

要素

UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 4

キーワード

HYDROLASE

機能・相同性

機能・相同性情報

adenosine receptor binding / protein localization to cell surface / TNFR1-induced proapoptotic signaling / spliceosomal tri-snRNP complex assembly / protein deubiquitination / negative regulation of protein ubiquitination / positive regulation of TORC1 signaling / TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway / Regulation of TNFR1 signaling / regulation of protein stability ...
類似検索 - 分子機能

生物種

HOMO SAPIENS (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.4 Å

データ登録者

Luna-Vargas, M.P.A. / Faesen, A.C. / van Dijk, W.J. / Rape, M. / Fish, A. / Sixma, T.K.

引用

ジャーナル: Nat.Commun. / 年: 2014
タイトル: The Dusp-Ubl Domain of Usp4 Enhances its Catalytic Efficiency by Promoting Ubiquitin Exchange.
著者: Clerici, M. / Luna-Vargas, M.P.A. / Faesen, A.C. / Sixma, T.K.

履歴

登録	2011年1月20日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2011年4月6日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2014年1月22日	Group: Database references / Refinement description / Version format compliance
改定 1.2	2014年10月22日	Group: Database references
改定 1.3	2014年12月3日	Group: Database references / Structure summary
改定 1.4	2023年12月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.5	2024年11月6日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	2y6e.cif.gz	826.2 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb2y6e.ent.gz	690.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	2y6e.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/y6/2y6e ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/y6/2y6e	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	2gfoS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3wci-d 4nhy-d 3lee-d 3vjb-d 3rfr-d 4pi2-d 3wch-d 3wef-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#60 - 2004年12月ユビキチン (Ubiquitin) 類似性 (2) #234 - 2019年6月 MDM2とがん (MDM2 and Cancer) 類似性 (2) #56 - 2004年8月カスパーゼ (Caspases) 類似性 (2)

登録構造単位

A: UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 4

B: UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 4

C: UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 4

D: UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 4

E: UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 4

F: UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 4

ヘテロ分子

254 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	110.500, 151.030, 178.670
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 4 / UBIQUITIN-SPECIFIC-PROCESSING PROTEASE 4 / DEUBIQUITINATING ENZYME 4 / UBIQUITIN THIOLESTERASE 4 / ...UBIQUITIN-SPECIFIC-PROCESSING PROTEASE 4 / DEUBIQUITINATING ENZYME 4 / UBIQUITIN THIOLESTERASE 4 / UBIQUITOUS NUCLEAR PROTEIN HOMOLOG / USP4 分子量: 42312.422 Da / 分子数: 6 / 断片: CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 296-490,765-932 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) HOMO SAPIENS (ヒト) / プラスミド: PET-NKI-B3C/LIC AND PET46-EK/LIC / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): ROSETTA2(DE3) PLYSS-T1R / 参照: UniProt: Q13107, EC: 3.1.2.15
#2: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1249 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.94 Å³/Da / 溶媒含有率: 58 % / 解説: NONE
結晶化	pH: 8.5 詳細: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 100MM BIS-TRIS PROPANE (PH8.5), 25MM NA2SO4, 18% PEG3350, THEN SOAKED IN 25% ETHYLENEGLYCOL

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID14-2 / 波長: 0.933
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 2009年9月6日 / 詳細: MIRRORS
放射	モノクロメーター: ASYMMETRIC LAUE 001 / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.933 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.4→44.6 Å / Num. obs: 111095 / % possible obs: 94.9 % / Observed criterion σ(I): 1.1 / 冗長度: 3.4 % / B_iso Wilson estimate: 53.38 Å² / R_merge(I) obs: 0.09 / Net I/σ(I): 11
反射シェル	解像度: 2.4→44.6 Å / 冗長度: 2.4 % / R_merge(I) obs: 0.66 / Mean I/σ(I) obs: 1.4 / % possible all: 74

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
BUSTER	2.8.0	精密化
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 2GFO

2gfo

解像度: 2.4→44.59 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.9415 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.925 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2104	5583	5.03 %	RANDOM
R_work	0.178	-	-	-
obs	0.1797	111095	-	-

原子変位パラメータ

B_iso mean: 52.31 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	4.2468 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-2.383 Å²	0 Å²
3-	-	-	-1.8638 Å²

Refine analyze

Luzzati coordinate error obs: 0.313 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.4→44.59 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	15933	0	16	1249	17198

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数	Restraint function	Weight
X-RAY DIFFRACTION	t_bond_d	0.01	16348	HARMONIC	2
X-RAY DIFFRACTION	t_angle_deg	1.02	22149	HARMONIC	2
X-RAY DIFFRACTION	t_dihedral_angle_d		7421	SINUSOIDAL	2
X-RAY DIFFRACTION	t_incorr_chiral_ct
X-RAY DIFFRACTION	t_pseud_angle
X-RAY DIFFRACTION	t_trig_c_planes		413	HARMONIC	2
X-RAY DIFFRACTION	t_gen_planes		2344	HARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_it		16348	HARMONIC	20
X-RAY DIFFRACTION	t_nbd		4	SEMIHARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_omega_torsion	3.05
X-RAY DIFFRACTION	t_other_torsion	2.88
X-RAY DIFFRACTION	t_improper_torsion		6	HARMONIC	0
X-RAY DIFFRACTION	t_chiral_improper_torsion		2026	SEMIHARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_sum_occupancies
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_distance
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_angle
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_torsion
X-RAY DIFFRACTION	t_ideal_dist_contact		18154	SEMIHARMONIC	4

LS精密化シェル

解像度: 2.4→2.46 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2599	329	5.52 %
R_work	0.2205	5636	-
all	0.2227	5965	-

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.7342	0.2956	-1.4048	2.1237	-0.075	2.5644	-0.0859	0.4179	0.0142	-0.3292	0.1176	0.3123	0.1119	-0.4643	-0.0317	-0.0345	-0.0961	-0.0989	-0.0407	0.0219	-0.1064	29.4511	32.2396	18.1231
2	1.1187	-1.425	-1.7138	0.04	1.7324	0.8426	-0.0038	-0.0209	-0.0149	-0.0094	-0.012	-0.0416	0.0163	0.0315	0.0158	0.0324	-0.0044	-0.0276	0.0925	-0.0763	0.0139	59.6207	35.3368	10.7813
3	3.3062	0.9004	-0.4814	1.9736	-0.5894	2.6963	0.0012	-0.0752	-0.0383	-0.0136	-0.0106	-0.2095	0.0747	0.4461	0.0094	-0.0293	-0.0601	0.0022	-0.0597	0.0281	-0.1272	53.1847	39.0061	26.3753
4	0.0365	-1.5997	0.0338	0.6832	-0.5959	0.3929	-0.0034	0.0196	-0.0556	0.0021	0.0151	-0.0198	0.0111	-0.0098	-0.0116	0.079	0.1518	0.0121	0.019	0.1017	0.0034	64.1821	26.0528	31.6742
5	2.6716	0.978	-0.3746	2.095	0.1225	1.3531	0.039	-0.109	0.3083	0.1732	0.0093	0.1773	-0.1252	0.0204	-0.0482	-0.0028	-0.049	0.0101	-0.1016	-0.0038	-0.1097	36.1544	39.2182	34.5514
6	1.8312	1.1854	-0.8816	2.733	0.0482	2.4195	-0.0844	-0.0371	-0.1221	-0.0138	-0.0213	-0.2034	0.0488	0.1308	0.1057	-0.0424	0.0369	0.0106	-0.0778	0.0319	-0.0452	16.4667	8.8075	48.6998
7	0.4481	1.9185	0.4572	2.165	0.6426	0.111	-0.0051	0.0024	-0.0071	-0.0235	-0.0064	-0.0107	0.0035	-0.0176	0.0116	0.0049	-0.0017	0.0436	0.0154	-0.0395	0.0795	-12.0019	-4.9672	50.7162
8	3.369	0.6559	0.3574	0.2852	-0.0245	2.3801	-0.0835	0.1569	-0.0079	0.0291	0.0049	0.3988	0.0962	-0.3772	0.0786	-0.1681	-0.0125	0.0587	-0.043	-0.0063	0.0396	-9.6287	9.7725	48.2369
9	0.4871	-0.2584	0.0442	0.5247	0.3383	0.0239	0.0008	0.0298	-0.0083	-0.011	-0.0113	-0.025	0.0405	0.0423	0.0105	-0.0504	-0.1513	0.0608	0.0707	-0.0973	0.0666	-17.7054	3.9163	33.5122
10	2.5411	0.5657	-0.431	2.0547	-0.0681	2.5426	-0.0723	-0.1159	0.4561	0.0698	0.0517	0.3698	-0.4214	-0.3714	0.0206	-0.0715	0.092	0.0236	-0.1591	0.0277	-0.0306	3.3723	23.0443	47.9836
11	2.0926	-0.1493	-0.1393	3.7101	0.4074	1.4817	-0.2133	-0.1661	0.0548	0.1163	0.2265	0.5442	-0.1972	-0.1505	-0.0132	-0.129	0.0681	-0.001	-0.1182	0.1365	0.0565	38.6578	-0.9214	48.1993
12	3.0209	0.6485	-0.9078	1.0057	-0.1627	2.1191	-0.078	0.1296	0.2054	-0.0684	0.0631	-0.1983	-0.2786	0.1965	0.0148	-0.0649	-0.0497	-0.0729	0.0139	0.0892	-0.0308	64.2338	2.1162	43.4557
13	0.3752	2.1385	-1.4209	0	-2.2927	0.5451	-0.0245	0.1037	0.0106	-0.0432	0.0401	-0.0121	-0.0523	0.1145	-0.0156	0.0482	-0.0224	0.041	0.0991	0.062	-0.068	67.3841	-3.9913	31.125
14	3.0468	0.8431	0.3327	3.3804	-0.7007	2.736	-0.1441	0.1028	-0.15	-0.0033	0.2193	0.2185	0.3	0.2525	-0.0752	-0.1016	0.0589	-0.0289	-0.1526	0.062	-0.0969	50.7117	-15.0657	43.6953
15	0.0596	0.0026	-0.0851	0.0262	-0.0336	0.0021	0.0024	0.0037	-0.0018	-0.0031	-0.002	0.0015	-0.0078	0.0158	-0.0004	0.037	0.0455	-0.0189	0.0201	-0.0118	0.0069	58.2669	-13.8835	59.8724
16	2.3905	0.4459	0.6424	2.9772	-0.5985	2.2742	-0.1247	0.361	0.1645	-0.2086	-0.0155	-0.2098	0.0621	0.1245	0.1402	-0.0536	-0.0905	0.0498	-0.0624	0.0744	-0.0783	23.481	-21.3565	16.6182
17	0.983	-1.543	1.0583	0.2676	-0.2445	0.867	-0.0068	0.006	0.0064	0.0063	-0.0162	0.041	-0.02	-0.002	0.023	0.0286	-0.0352	-0.025	0.0411	0.0575	0.0315	-2.991	-24.917	7.2859
18	1.7673	0.6208	0.6708	0.9237	0.1885	0	-0.0586	-0.0904	0.1083	0.1458	0.1553	0.5442	-0.0618	-0.2913	-0.0967	-0.0385	-0.0747	0.083	-0.0792	0.1229	0.0974	-2.3018	-28.6505	24.7924
19	1.6069	0.2343	0.616	1.2434	0.068	0.5854	-0.0145	-0.1483	-0.1762	0.0927	0.1173	0.1837	0.1128	-0.1528	-0.1028	0.0371	-0.1042	0.0754	-0.0971	0.0569	-0.0074	9.4884	-30.0717	32.5535
20	4.0482	0.8896	0.472	3.9984	-0.8891	0.9451	-0.0853	-0.021	-0.4413	0.2139	-0.127	-0.2462	0.0544	0.0921	0.2123	-0.0275	-0.0498	0.0214	-0.1244	0.0745	-0.0209	23.7021	-31.7469	31.3203
21	3.417	1.5605	-0.9351	0.8488	1.5148	3.3913	0.0231	0.1424	0.1547	0.0477	0.1271	-0.0428	-0.1347	0.1887	-0.1503	-0.0244	-0.1004	-0.0849	0.0095	0.054	-0.0893	13.5056	21.8583	-0.5757
22	2.2345	-0.2744	0.2189	2.4145	0.4393	3.4636	0.0745	-0.2452	0.146	0.2026	0.092	-0.1047	-0.0054	0.0878	-0.1665	-0.06	-0.0872	-0.1312	-0.0112	0.0292	-0.1199	11.3739	19.5176	8.5558
23	3.5504	0.6468	0.2379	0.2755	-0.3754	0.8232	-0.0191	-0.2021	-0.1904	0.0314	0.0573	0.2658	0.2774	-0.4919	-0.0382	-0.1221	-0.152	-0.1122	0.1213	0.1127	-0.0784	-11.2464	8.0004	0.7636
24	2.2595	0.3559	-1.2016	1.5645	-0.8111	2.084	0.0105	0.3617	-0.1032	-0.3514	0.1352	0.087	0.3901	-0.2873	-0.1457	-0.0563	-0.0847	-0.152	0.0556	0.0262	-0.1929	7.5942	8.6835	-8.72
25	0	-0.3087	-0.2195	0.1249	-0.4373	0.0059	-0.0001	0.0072	0.0027	0.0104	-0.0055	-0.0029	0.0095	0.025	0.0056	0.0354	0.1164	-0.0152	-0.0283	0.0896	0.0551	-10.1957	23.7277	-17.2842
26	4.355	0.5781	-0.6742	2.7917	-1.2961	5.2568	0.0779	-0.2576	-0.5442	0.014	-0.0435	0.0077	0.1301	-0.1487	-0.0344	-0.1066	-0.1213	0.0121	-0.0468	0.0564	-0.1392	37.8969	-11.1087	2.2091
27	0.5677	0.8809	1.2305	0.4797	-2.7124	1.9802	0.0418	-0.2982	-0.1282	0.1056	-0.1316	-0.1216	-0.1491	0.1686	0.0898	-0.0104	-0.152	0.0188	0.1274	0.0326	-0.1433	48.9539	-3.544	7.5945
28	5.8096	1.0834	-0.2528	0.1285	-0.0346	0.9065	-0.0336	-0.4507	0.081	-0.0801	-0.0562	-0.306	-0.1973	0.4428	0.0898	-0.1567	-0.152	0.0147	0.1756	0.0556	-0.1947	62.5867	3.993	-2.3889
29	1.4155	-0.7265	1.3323	3.691	2.0365	0.3312	-0.0079	0.1346	0.1788	0.0962	-0.0911	-0.0856	-0.2227	0.1882	0.099	0.1286	-0.1514	0.152	-0.0246	0.055	-0.1787	50.1159	8.8215	-7.8193
30	3.3723	1.7858	-0.0106	1.1651	-2.4885	4.8901	-0.0391	0.2916	-0.0408	-0.185	0.3255	0.0215	-0.1869	-0.2468	-0.2864	-0.0149	-0.0657	0.0368	0.0142	0.0059	-0.2136	38.5976	0.4911	-11.7049

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(A 297 - A 412 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(A 413 - A 425 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(A 426 - A 786 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(A 787 - A 810 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(A 811 - A 924 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(B 296 - B 413 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(B 414 - B 425 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(B 426 - B 787 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(B 788 - B 810 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(B 811 - B 929 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(C 296 - C 412 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(C 413 - C 775 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(C 776 - C 810 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(C 811 - C 922 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(C 923 - C 924 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(D 297 - D 412 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(D 413 - D 425 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(D 426 - D 812 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(D 813 - D 863 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(D 864 - D 927 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(E 297 - E 336 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(E 337 - E 412 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(E 413 - E 816 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(E 817 - E 924 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(E 925 - E 928 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(F 296 - F 385 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(F 386 - F 423 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(F 424 - F 823 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(F 824 - F 865 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(F 866 - F 926 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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