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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2tmp | ||||||
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タイトル | N-TERMINAL DOMAIN OF TISSUE INHIBITOR OF METALLOPROTEINASE-2 (N-TIMP-2), NMR, 49 STRUCTURES | ||||||
![]() | TISSUE INHIBITOR OF METALLOPROTEINASES-2 | ||||||
![]() | METALLOPROTEASE INHIBITOR / TIMP / METALLOPROTEINASE INHIBITOR / OB PROTEIN FOLD | ||||||
機能・相同性 | ![]() negative regulation of metallopeptidase activity / negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis / peptidase inhibitor activity / metalloendopeptidase inhibitor activity / molecular function inhibitor activity / Activation of Matrix Metalloproteinases / extracellular matrix / response to hormone / response to cytokine / specific granule lumen ...negative regulation of metallopeptidase activity / negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis / peptidase inhibitor activity / metalloendopeptidase inhibitor activity / molecular function inhibitor activity / Activation of Matrix Metalloproteinases / extracellular matrix / response to hormone / response to cytokine / specific granule lumen / tertiary granule lumen / collagen-containing extracellular matrix / protease binding / ficolin-1-rich granule lumen / Neutrophil degranulation / extracellular space / zinc ion binding / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / SIMULATED ANNEALING USING TORSION ANGLE DYNAMICS | ||||||
![]() | Muskett, F.W. / Frenkiel, T.A. / Feeney, J. / Freedman, R.B. / Carr, M.D. / Williamson, R.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: High resolution structure of the N-terminal domain of tissue inhibitor of metalloproteinases-2 and characterization of its interaction site with matrix metalloproteinase-3. 著者: Muskett, F.W. / Frenkiel, T.A. / Feeney, J. / Freedman, R.B. / Carr, M.D. / Williamson, R.A. #1: ![]() タイトル: Mapping the Binding Site for Matrix Metalloproteinase on the N-Terminal Domain of the Tissue Inhibitor of Metalloproteinases-2 by NMR Chemical Shift Perturbation 著者: Williamson, R.A. / Carr, M.D. / Frenkiel, T.A. / Feeney, J. / Freedman, R.B. #2: ![]() タイトル: Chemically and Conformationally Authentic Active Domain of Human Tissue Inhibitor of Metalloproteinases-2 Refolded from Bacterial Inclusion Bodies 著者: Williamson, R.A. / Natalia, D. / Gee, C.K. / Murphy, G. / Carr, M.D. / Freedman, R.B. #3: ![]() タイトル: Solution Structure of the Active Domain of Tissue Inhibitor of Metalloproteinases-2. A New Member of the Ob Fold Protein Family 著者: Williamson, R.A. / Martorell, G. / Carr, M.D. / Murphy, G. / Docherty, A.J. / Freedman, R.B. / Feeney, J. #4: ![]() タイトル: Disulphide Bond Assignment in Human Tissue Inhibitor of Metalloproteinases (Timp) 著者: Williamson, R.A. / Marston, F.A. / Angal, S. / Koklitis, P. / Panico, M. / Morris, H.R. / Carne, A.F. / Smith, B.J. / Harris, T.J. / Freedman, R.B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 1.8 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 1.6 MB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 346.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 824.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 264 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 335 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14109.167 Da / 分子数: 1 / 断片: N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-127 / 変異: A21T / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 細胞内の位置 (発現宿主): INTRACELLULAR INCLUSION BODIES 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE CLOSEST TO THE MEAN OF THE 49 CONFORMERS |
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試料調製
詳細 | 内容: AQUEOUS |
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試料状態 | イオン強度: 125 mM / pH: 6.7 / 圧: 1 ATMOSPHERE / 温度: 308 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITYPLUS & INOVA / 製造業者: Varian / モデル: UNITYPLUS & INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: SIMULATED ANNEALING USING TORSION ANGLE DYNAMICS / ソフトェア番号: 1 詳細: SEE GUNTERT ET AL. (1997) J. MOL. BIOL. 273(1), 283-298 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATION 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 49 |