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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2sas | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF A SARCOPLASMIC CALCIUM-BINDING PROTEIN FROM AMPHIOXUS REFINED AT 2.4 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | SARCOPLASMIC CALCIUM-BINDING PROTEIN | ||||||
![]() | CALCIUM-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Cook, W.J. / Babu, Y.S. / Cox, J.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of a sarcoplasmic calcium-binding protein from amphioxus refined at 2.4 A resolution. 著者: Cook, W.J. / Jeffrey, L.C. / Cox, J.A. / Vijay-Kumar, S. #1: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Investigation of a Sarcoplasmic Calcium-Binding Protein from Amphioxus 著者: Cook, W.J. / Babu, Y.S. / Cox, J.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 44.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 35.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21307.867 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P04570 | ||
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#2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.34 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.47 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 24 ℃ / pH: 8.8 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.4 Å / Num. obs: 8157 / % possible obs: 98.7 % / Num. measured all: 45101 / Rmerge(I) obs: 0.0909 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.4→5 Å / Rfactor Rwork: 0.199 / Rfactor obs: 0.199 / σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→5 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR/PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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