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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2phl | ||||||
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タイトル | THE STRUCTURE OF PHASEOLIN AT 2.2 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR A COMMON VICILIN(SLASH)LEGUMIN STRUCTURE AND THE GENETIC ENGINEERING OF SEED STORAGE PROTEINS | ||||||
![]() | PHASEOLIN | ||||||
![]() | PLANT SEED STORAGE PROTEIN(VICILIN) | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Lawrence, M.C. / Izard, T. / Beuchat, M. / Blagrove, R.J. / Colman, P.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of phaseolin at 2.2 A resolution. Implications for a common vicilin/legumin structure and the genetic engineering of seed storage proteins. 著者: Lawrence, M.C. / Izard, T. / Beuchat, M. / Blagrove, R.J. / Colman, P.M. #1: ![]() タイトル: The Three-Dimensional Structure of the Seed Storage Protein Phaseolin at 3 Angstroms Resolution 著者: Lawrence, M.C. / Suzuki, E. / Varghese, J.N. / Davis, P.C. / Van Donkelaar, A. / Tulloch, P.A. / Colman, P.M. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET THERE ARE SEVERAL BIFURCATED SHEETS IN THIS STRUCTURE. THESE ARE REPRESENTED BY TWO SHEETS ...SHEET THERE ARE SEVERAL BIFURCATED SHEETS IN THIS STRUCTURE. THESE ARE REPRESENTED BY TWO SHEETS WHICH HAVE ONE OR MORE IDENTICAL STRANDS. SHEETS *N2A* AND *N2B* REPRESENT ONE BIFURCATED SHEET. SHEETS *C2A* AND *C2B* ALSO REPRESENT ONE BIFURCATED SHEET. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 217.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 180.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 477.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 505.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 40.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 55.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 45043.035 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() #2: 糖 | #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.6 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.65 % |
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解析
ソフトウェア | 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.2→6 Å / σ(F): 1 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / Rfactor obs: 0.178 / Rfactor Rwork: 0.178 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 1.8 |