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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2pft | ||||||
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タイトル | The Crystal Structure of Mouse Exo70 Reveals Unique Features of the Mammalian Exocyst | ||||||
![]() | Exocytosis Protein | ||||||
![]() | ENDOCYTOSIS/EXOCYTOSIS / helix-turn-helix / ENDOCYTOSIS-EXOCYTOSIS COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | ![]() Insulin processing / VxPx cargo-targeting to cilium / regulation of entry of bacterium into host cell / exocyst / growth cone membrane / Flemming body / microtubule organizing center / exocytosis / centriolar satellite / protein transport ...Insulin processing / VxPx cargo-targeting to cilium / regulation of entry of bacterium into host cell / exocyst / growth cone membrane / Flemming body / microtubule organizing center / exocytosis / centriolar satellite / protein transport / plasma membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Moore, B.A. / Xu, Z. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The crystal structure of mouse Exo70 reveals unique features of the mammalian exocyst. 著者: Moore, B.A. / Robinson, H.H. / Xu, Z. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 122.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 90.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 428.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 440.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 22.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 31.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 65555.477 Da / 分子数: 1 / 断片: Residues 85-653 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.46 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.9 % |
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結晶化 | 温度: 293.15 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: Precipitant in drop: 10% ethylene glycol, 5% PEG 8000, 0.01M magnesium chloride, 0.1M HEPES Precipitant in well: 10% ethylene glycol, 8% PEG 8000, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING ...詳細: Precipitant in drop: 10% ethylene glycol, 5% PEG 8000, 0.01M magnesium chloride, 0.1M HEPES Precipitant in well: 10% ethylene glycol, 8% PEG 8000, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K |
-データ収集
回折 |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
検出器 | タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2006年7月19日 / 詳細: Adjustable focusing mirrors in K-B geometry | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
放射 | モノクロメーター: Si(111) Double Crystal / プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
放射波長 |
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Reflection | D res high: 2.5 Å / D res low: 50 Å
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Diffraction reflection shell |
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反射 | 解像度: 2.25→46.84 Å / Num. all: 31423 / Num. obs: 30334 / % possible obs: 93.7 % / Observed criterion σ(F): 0 / 冗長度: 4.2 % / Biso Wilson estimate: 40.4 Å2 / Limit h max: 24 / Limit h min: 0 / Limit k max: 24 / Limit k min: 0 / Limit l max: 133 / Limit l min: 0 / Observed criterion F max: 127192.55 / Observed criterion F min: 0.32 / Rmerge(I) obs: 0.054 / Χ2: 1.26 / Net I/σ(I): 15.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
反射 シェル | 解像度: 2.25→2.33 Å / 冗長度: 3.1 % / Rmerge(I) obs: 0.416 / Num. unique all: 2448 / Χ2: 1.093 / % possible all: 77.7 |
-位相決定
位相決定 | 手法: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Phasing MAD set |
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Phasing MAD set shell |
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