登録情報 | データベース: PDB / ID: 2owc |
---|
タイトル | Structure of a covalent intermediate in Thermus thermophilus amylomaltase |
---|
要素 | 4-alpha-glucanotransferase |
---|
キーワード | TRANSFERASE / amylomaltase / alpha-amylase / beta-alpha-barrel / glycosyl-enzyme |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
4-alpha-glucanotransferase / 4-alpha-glucanotransferase activity / : / carbohydrate metabolic process / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Glycoside hydrolase, family 77 / 4-alpha-glucanotransferase / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 acarbose-derived trisaccharide / MALONATE ION / 4-alpha-glucanotransferase / 4-alpha-glucanotransferase類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | Thermus thermophilus (バクテリア) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.05 Å |
---|
データ登録者 | Barends, T.R.M. / Bultema, J.B. / Kaper, T. / van der Maarel, M.J.E.C. / Dijkhuizen, L. / Dijkstra, B.W. |
---|
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2007 タイトル: Three-way stabilization of the covalent intermediate in amylomaltase, an alpha-amylase-like transglycosylase. 著者: Barends, T.R. / Bultema, J.B. / Kaper, T. / van der Maarel, M.J. / Dijkhuizen, L. / Dijkstra, B.W. |
---|
履歴 | 登録 | 2007年2月16日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2007年4月3日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2008年5月1日 | Group: Version format compliance |
---|
改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
---|
改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / database_PDB_caveat / entity / entity_name_com / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_molecule_features / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_validate_chiral / pdbx_validate_close_contact / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.type / _pdbx_validate_chiral.auth_asym_id / _pdbx_validate_chiral.auth_atom_id / _pdbx_validate_chiral.auth_comp_id / _pdbx_validate_chiral.auth_seq_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
---|
改定 2.1 | 2023年8月30日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
---|
改定 3.0 | 2023年11月15日 | Group: Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom ...atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_validate_main_chain_plane / pdbx_validate_rmsd_angle / struct_conn Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
---|
|
---|