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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ory | ||||||
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タイトル | Crystal structure of M37 lipase | ||||||
![]() | Lipase | ||||||
![]() | HYDROLASE / alpha/beta hydrolase | ||||||
機能・相同性 | Fungal lipase-like domain / Lipase (class 3) / lipid metabolic process / Alpha/Beta hydrolase fold, catalytic domain / Alpha/Beta hydrolase fold / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta / Lipase![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Jung, S.K. / Jeong, D.G. / Kim, S.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural basis for the cold adaptation of psychrophilic M37 lipase from Photobacterium lipolyticum. 著者: Jung, S.K. / Jeong, D.G. / Lee, M.S. / Lee, J.K. / Kim, H.K. / Ryu, S.E. / Park, B.C. / Kim, J.H. / Kim, S.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 141.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 113.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 38897.945 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() プラスミド: pET22b / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.15 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.87 % |
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.5 詳細: 0.2M Ammonium acetate, 23-25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 93 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2005年7月6日 / 詳細: mirrors |
放射 | モノクロメーター: mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.2→50 Å / Num. all: 34828 / Num. obs: 34410 / % possible obs: 98.8 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 6.3 % / Rsym value: 0.052 / Net I/σ(I): 11.7 |
反射 シェル | 解像度: 2.2→2.32 Å / 冗長度: 4.3 % / Mean I/σ(I) obs: 3.6 / Num. unique all: 4898 / Rsym value: 0.215 / % possible all: 99 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→50 Å
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拘束条件 |
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