登録情報 | データベース: PDB / ID: 2o8o |
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タイトル | Crystal structure of Clostridium histolyticum colg collagenase collagen-binding domain 3B at 1.35 Angstrom resolution in presence of calcium |
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要素 | Collagenase |
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キーワード | HYDROLASE / helix to beta transtition |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tripeptidase activity / microbial collagenase / collagen metabolic process / collagen binding / metalloendopeptidase activity / endopeptidase activity / calcium ion binding / proteolysis / extracellular region / zinc ion binding類似検索 - 分子機能 Jelly Rolls - #380 / Collagenase ColG, catalytic helper subdomain / Collagenase G catalytic helper subdomain / Peptidase M9A/M9B, collagenase, bacterial / Peptidase M9, collagenase, N-terminal domain / Collagenase / Peptidase family M9 N-terminal / PKD domain / Peptidase, C-terminal, archaeal/bacterial / Bacterial pre-peptidase C-terminal domain ...Jelly Rolls - #380 / Collagenase ColG, catalytic helper subdomain / Collagenase G catalytic helper subdomain / Peptidase M9A/M9B, collagenase, bacterial / Peptidase M9, collagenase, N-terminal domain / Collagenase / Peptidase family M9 N-terminal / PKD domain / Peptidase, C-terminal, archaeal/bacterial / Bacterial pre-peptidase C-terminal domain / Polycystic kidney disease (PKD) domain profile. / PKD domain / PKD domain superfamily / PKD/Chitinase domain / Repeats in polycystic kidney disease 1 (PKD1) and other proteins / Neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding region signature. / Jelly Rolls / Immunoglobulin-like fold / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Clostridium histolyticum (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / AB INITIO / 解像度: 1.35 Å |
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データ登録者 | Philominathan, S.T.L. / Wilson, J.J. / Matsushita, O. / Sakon, J. |
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引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Induction of stable beta-sheet by Ca2+ in Clostridial collagen binding domain 著者: Philominathan, S.T.L. / Wilson, J.J. / Matsushita, O. / Sakon, J. |
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履歴 | 登録 | 2006年12月12日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2007年12月11日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年10月25日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_struct_assembly_auth_evidence |
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改定 1.3 | 2018年1月24日 | Group: Structure summary / カテゴリ: audit_author / Item: _audit_author.name |
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改定 1.4 | 2023年12月27日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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