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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2neo | |||||||||||||||||||||
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タイトル | SOLUTION NMR STRUCTURE OF A TWO-BASE DNA BULGE COMPLEXED WITH AN ENEDIYNE CLEAVING ANALOG, 11 STRUCTURES | |||||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / BULGE DNA / ENEDIYNE ANTIBIOTICS ANTITUMOR AGENTS / CARBOHYDRATES / BULGE BINDING LIGANDS / DEOXYRIBONUCLEIC ACID | 機能・相同性 | Chem-NCS / DNA / DNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / DISTANCE GEOMETRY, MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS | ![]() Stassinopoulos, A. / Ji, J. / Gao, X. / Goldberg, I.H. | ![]() ![]() タイトル: Solution structure of a two-base DNA bulge complexed with an enediyne cleaving analog. 著者: Stassinopoulos, A. / Ji, J. / Gao, X. / Goldberg, I.H. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 169.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 120.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 439.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 522.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 25.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 39.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 5649.725 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: NEOCARZINOSTATIN CHROMOPHORE DERIVATIVE (NCSI-GB)-BULGE-D(CCCGATCG-LINKER-GCAATTCGGG) COMPLEX |
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#2: 化合物 | ChemComp-NCS / |
非ポリマーの詳細 | PGE: THE LINKER IS TRIETHYLEN |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
試料状態 | pH: 6. / 温度: 278 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AMX II / 製造業者: Bruker / モデル: AMX II / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DISTANCE GEOMETRY, MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | 計算したコンフォーマーの数: 7 / 登録したコンフォーマーの数: 11 |