+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2n7p | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Solution structure of PDZ domain | ||||||
![]() | Putative uncharacterized protein | ||||||
![]() | TRANSFERASE / PDZ | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model1 | ||||||
![]() | Mei, S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structure of Q388A3 PDZ domain from Trypanosoma brucei and its interaction with OMP-like peptide 著者: Mei, S. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 694.8 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 592.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 532.5 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 733.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 49 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 63.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
---|---|
その他のデータベース |
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10985.445 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP RESIDUES 1528-1630 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: 927/4 GUTat10.1 / 遺伝子: Tb10.61.1430 / 発現宿主: ![]() ![]() |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
---|---|
NMR実験 | タイプ: 2D 1H-15N ![]() |
-
試料調製
詳細 | 内容: 100 mM sodium chloride-1, 90% H2O/10% D2O / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
---|---|
試料 | 濃度: 100 mM / 構成要素: sodium chloride-1 |
試料状態 | イオン強度: 0.1 / pH: 6.5 / 圧: ambient / 温度: 20 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX / 製造業者: Bruker / モデル: DMX / 磁場強度: 600 MHz |
---|
-
解析
NMR software |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 500 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 1 |