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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2my5 | ||||||
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タイトル | Solution Structure of KstB-PCP in kosinostatin biosynthesis | ||||||
要素 | Peptidyl carrier protein | ||||||
キーワード | TRANSPORT PROTEIN / Ppant binnding domain | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 ACP-like / Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A / Phosphopantetheine attachment site / ACP-like superfamily / Carrier protein (CP) domain profile. / Phosphopantetheine binding ACP domain / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha 類似検索 - ドメイン・相同性 | ||||||
生物種 | Micromonospora sp. TP-A0468 (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | fewest violations and lowest energy, model1 | ||||||
データ登録者 | Zhao, B. / Lan, W. / Wang, C. / Tang, G. / Cao, C. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: 1H and 15N Assigned Chemical Shifts for KstB-PCP 著者: Zhao, B. / Lan, W. / Wang, C. / Tang, G. / Cao, C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2my5.cif.gz | 537.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2my5.ent.gz | 452.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2my5.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/my/2my5 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/my/2my5 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 9664.883 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Micromonospora sp. TP-A0468 (バクテリア) 遺伝子: KstB2 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): Rosetta(DE3) / 参照: UniProt: A0A023GUP0 |
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#2: 化合物 | ChemComp-PN7 / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: 3D CBCA(CO)NH |
-試料調製
詳細 | 内容: 2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] KstB-PCP(holo)-1, 90% H2O, 10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 2 mM / 構成要素: KstB-PCP(holo)-1 / Isotopic labeling: [U-99% 13C; U-99% 15N] |
試料状態 | pH: 7 / Temperature units: K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: AGILENT INOVA / 製造業者: Agilent / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software | 名称: CNS / 分類: 精密化 |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 |
代表構造 | 選択基準: fewest violations and lowest energy |
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: 20 / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 1 |