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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2msp | ||||||
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タイトル | MAJOR SPERM PROTEIN, BETA ISOFORM, ENGINEERED C59S/T90C MUTANT, PUTATIVE SUBFILAMENT STRUCTURE, PH 8.5 | ||||||
![]() | MAJOR SPERM PROTEIN | ||||||
![]() | CELL MOTILITY PROTEIN / CYTOSKELETAL PROTEIN / NEMATODE SPERM CELL MOTILITY PROTEIN / FILAMENTOUS PROTEIN STRUCTURE | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Bullock, T.L. / Mccoy, A.J. / Stewart, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural basis for amoeboid motility in nematode sperm. 著者: Bullock, T.L. / McCoy, A.J. / Kent, H.M. / Roberts, T.M. / Stewart, M. #1: ![]() タイトル: 2.5 A Resolution Crystal Structure of the Motile Major Sperm Protein (Msp) of Ascaris Suum 著者: Bullock, T.L. / Roberts, T.M. / Stewart, M. #2: ![]() タイトル: Worm Sperm and Advances in Cell Locomotion 著者: Theriot, J.A. #3: ![]() タイトル: Crystallization of the Motile Major Sperm Protein (Msp) of the Nematode Ascaris Suum 著者: Stewart, M. / King, K.L. / Roberts, T.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 203 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 163.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1mspS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14120.876 Da / 分子数: 8 / 変異: C59S, T90C / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: BETA ISOFORM / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.25 Å3/Da / 溶媒含有率: 62.21 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 8.5 詳細: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 16% PEG 6000, 80MM AMMONIUM SULFATE, 100MM TRIS - HCL, PH 8.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / pH: 7.4 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1997年1月1日 / 詳細: OPTICS |
放射 | モノクロメーター: MONOCHROMATOR / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.3→50 Å / Num. obs: 23854 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 11.7 % / Rmerge(I) obs: 0.118 / Net I/σ(I): 5.7 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 279016 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1MSP 解像度: 3.3→10 Å / Isotropic thermal model: TNT BCORREL / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: TNT
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: DEFAULT METHOD OF TNT / Bsol: 294 Å2 / ksol: 0.05 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.3→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / バージョン: 5D / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor Rfree: 0.263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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