内容: 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Alkaline phosphatase, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Trigger Factor, 100 mM potassium chloride, 3 mM BME, 20 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
0.5mM
Alkalinephosphatase
[U-100% 13C; U-100% 15N]
1
0.5mM
TriggerFactor
[U-100% 13C; U-100% 15N]
1
100mM
potassium chloride-3
1
3mM
BME-4
1
20mM
potassium phosphate-5
1
試料状態
イオン強度: 100 / pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 295 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Varian INOVA
Varian
INOVA
600
1
Varian INOVA
Varian
INOVA
800
2
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
700
3
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
600
4
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
NMRPipe
Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, PfeiferandBax
解析
Sparky
3.113
Goddard
chemicalshiftassignment
CNS
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
Olivia
1.16
Olivia, YokochiMasashi
chemicalshiftassignment
CYANA
3
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
TopSpin
3.1
BrukerBiospin
collection
VnmrJ
Varian
collection
X-PLOR NIH
Schwieters, Kuszewski, TjandraandClore
構造決定
TALOSN
ShenandBax
geometryoptimization
PSVS
1.5
BhattacharyaandMontelione
構造検証
精密化
手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1
NMR constraints
NOE constraints total: 1130 / NOE intraresidue total count: 267 / NOE medium range total count: 415 / NOE sequential total count: 311
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 1000 / 登録したコンフォーマーの数: 10 / Maximum torsion angle constraint violation: 11.3 ° / Maximum upper distance constraint violation: 0.5 Å