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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2mel | ||||||
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タイトル | NMR solution structure of the GS-TAMAPIN MUTATION R7A | ||||||
![]() | Potassium channel toxin alpha-KTx 5.4 | ||||||
![]() | TOXIN / Scorpion toxin / tamapin / alpha KTx5.4 mutant R7A | ||||||
機能・相同性 | Scorpion short toxins signature. / Scorpion short chain toxin, potassium channel inhibitor / Scorpion short toxin, BmKK2 / Knottin, scorpion toxin-like superfamily / ion channel inhibitor activity / potassium channel regulator activity / toxin activity / extracellular region / Potassium channel toxin alpha-KTx 5.4![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
![]() | del Rio-Portilla, F. / Ramirez-Cordero, B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Cytotoxicity of recombinant tamapin and related toxin-like peptides on model cell lines. 著者: Ramirez-Cordero, B. / Toledano, Y. / Cano-Sanchez, P. / Hernandez-Lopez, R. / Flores-Solis, D. / Saucedo-Yanez, A.L. / Chavez-Uribe, I. / Brieba, L.G. / Del Rio-Portilla, F. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 183.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 160.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 360.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 449.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 19.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3528.199 Da / 分子数: 1 / 変異: R9A / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 2.5 mM protein, 95% H2O/5% D2O / 溶媒系: 95% H2O/5% D2O |
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試料 | 濃度: 2.5 mM / 構成要素: entity-1 |
試料状態 | pH: 3.35 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 500 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 524 / NOE long range total count: 97 / NOE medium range total count: 115 | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |