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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2mdx | ||||||
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タイトル | Solution structure of the human wild type FAPP1-PH domain | ||||||
![]() | Pleckstrin homology domain-containing family A member 3 | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / pleckstrin homology / phosphoinositide | ||||||
機能・相同性 | ![]() receptor recycling / endosome organization / retrograde transport, endosome to Golgi / phosphatidylinositol-4-phosphate binding / Synthesis of PIPs at the plasma membrane / trans-Golgi network / recycling endosome / early endosome / Golgi membrane / Golgi apparatus ...receptor recycling / endosome organization / retrograde transport, endosome to Golgi / phosphatidylinositol-4-phosphate binding / Synthesis of PIPs at the plasma membrane / trans-Golgi network / recycling endosome / early endosome / Golgi membrane / Golgi apparatus / identical protein binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / DGSA-distance geometry simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
![]() | Lenoir, M. / Overduin, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structure of the human wild type FAPP1-PH domain 著者: Lenoir, M. / Overduin, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 335.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 276.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 408.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 492.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 24 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 37.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12235.950 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 1-100 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1 mM DTT, 20 mM TRIS, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 240 / pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: DGSA-distance geometry simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: final stage of the calculations is refined in explicit water | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |