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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2m5h | ||||||
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タイトル | NMR structure note: solution structure of monomeric human FAM96A | ||||||
![]() | MIP18 family protein FAM96A | ||||||
![]() | IMMUNE SYSTEM / FAM96A / DUF59 / 3D Domain Swapping | ||||||
機能・相同性 | ![]() cytosolic [4Fe-4S] assembly targeting complex / protein maturation by [4Fe-4S] cluster transfer / protein maturation by iron-sulfur cluster transfer / iron-sulfur cluster assembly / chromosome segregation / nucleoplasm / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics, simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model1 | ||||||
![]() | Ouyang, B. / Xia, B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structure of monomeric human FAM96A 著者: Ouyang, B. / Wang, L. / Wan, S. / Luo, Y. / Wang, L. / Lin, J. / Xia, B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 890.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 750.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16254.600 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 28-160 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Fam96a-1, 50 mM sodium phosphate-2, 50 mM sodium chloride-3, 1 mM EDTA-4, 50 mM DTT-5, 50 mM ARG-6, 50 mM GLU-7, 5 % D2O-8, 95 % H2O-9, 95% H2O/5% D2O 溶媒系: 95% H2O/5% D2O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 100 / pH: 7 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics, simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 4225 / NOE intraresidue total count: 1723 / NOE long range total count: 366 / NOE medium range total count: 300 / NOE sequential total count: 636 / Hydrogen bond constraints total count: 50 / Protein chi angle constraints total count: 0 / Protein other angle constraints total count: 523 / Protein phi angle constraints total count: 80 / Protein psi angle constraints total count: 79 | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / Maximum torsion angle constraint violation: 0 ° / Maximum upper distance constraint violation: 0.194 Å / 代表コンフォーマー: 1 |