1.1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Nedd4 WW3* domain, 2.2 mM alpha ENaC PY peptide, 20 mM sodium phosphate, 0.1 % sodium azide, 1 mM TSP, 93% H2O/7% D2O
93% H2O/7% D2O
2
3.0 mM Nedd4 WW3* domain, 1.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] alpha ENaC PY peptide, 20 mM sodium phosphate, 0.1 % sodium azide, 1.0 mM TSP, 93% H2O/7% D2O
93% H2O/7% D2O
3
1.61 mM [U-99% 15N] Nedd4 WW3* domain, 4.38 mM alpha ENaC PY peptide, 20 mM sodium phosphate, 0.1 % sodium azide, 1 mM TSP, 93% H2O/7% D2O
93% H2O/7% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
1.1mM
Nedd4 WW3* domain-1
[U-99% 13C; U-99% 15N]
1
2.2mM
alpha ENaC PY peptide-2
1
20mM
sodium phosphate-3
1
0.1 %
sodium azide-4
1
1mM
TSP-5
1
3.0mM
Nedd4 WW3* domain-6
2
1.5mM
alpha ENaC PY peptide-7
[U-99% 13C; U-99% 15N]
2
20mM
sodium phosphate-8
2
0.1 %
sodium azide-9
2
1.0mM
TSP-10
2
1.61mM
Nedd4 WW3* domain-11
[U-99% 15N]
3
4.38mM
alpha ENaC PY peptide-12
3
20mM
sodium phosphate-13
3
0.1 %
sodium azide-14
3
1mM
TSP-15
3
試料状態
イオン強度: 0.02 / pH: 6.5 / 圧: ambient / 温度: 298 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
600
1
Varian Direct Drive
Varian
DirectDrive
800
2
Varian Direct Drive
Varian
DirectDrive
900
3
Varian Unity INOVA
Varian
UnityINOVA
600
4
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
TopSpin
2.1pl3
BrukerBiospin
collection
CcpNMR
2.07
CCPN
peakpicking
CcpNMR
2.07
CCPN
chemicalshiftassignment
NMRPipe
Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, PfeiferandBax
解析
CYANA
2.1
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
CNS
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
relax
2.0.0
d'Auvergne, E. J. andGooley, P. R.
データ解析
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT AGAINST DISTANCE, TORSION ANGLE AND RDC CONSTRAINTS IN A 8 ANGSTROM WATER SHELL, USING A MODIFIED VERSION OF THE WATERREFCNS SCRIPTS.
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 15