+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l4b | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Solution structure of a putative acyl carrier protein from Anaplasma phagocytophilum. Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease target AnphA.01018.a | ||||||
要素 | Acyl carrier protein | ||||||
キーワード | TRANSFERASE / infectious disease / Human granulocytic anaplasmosis / SSGCID / Structural Genomics / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Anaplasma phagocytophilum (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
Model details | closest to the average, model 1 | ||||||
データ登録者 | Buchko, G.W. / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID) | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Solution structure of a putative acyl carrier protein from Anaplasma phagocytophilum. Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease target AnphA.01018.a 著者: Buchko, G.W. / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID) | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2l4b.cif.gz | 605 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb2l4b.ent.gz | 518.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2l4b.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2l4b_validation.pdf.gz | 463.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | 2l4b_full_validation.pdf.gz | 696.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2l4b_validation.xml.gz | 50.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2l4b_validation.cif.gz | 60.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/l4/2l4b ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/l4/2l4b | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
---|---|
その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 9783.935 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Anaplasma phagocytophilum (バクテリア) 株: HZ / 遺伝子: APH_0929 / プラスミド: AVA0421 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / 参照: UniProt: Q2GJE9 |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
|
-試料調製
詳細 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
試料 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
試料状態 | イオン強度: 0.12 / pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 293 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
|
---|
-解析
NMR software |
| ||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |